실험 데이터 정보학 통합을 위한 Dotmatics BioBright 솔루션

실험 정보 시스템에서 기기 데이터를 기록 및 분석하기 위한 원활한 워크플로우

데모 요청
Overview

기기에서 ELN까지

분석 기기에서 생성되는 데이터중에는 ELN 혹은 어세이 데이터관리 시스템에 기록해야하는 경우가 많습니다. 기기에서 나온 결과 데이터를  ELN으로 자동으로 기록이 불가하기에 LIMS에서 내보기하거나  네트워크에서 공유 파일을 검색, USB키에서 물리적으로 파일을 옮기는 등의 방법을 이용하여 수동으로 데이터를 옮겨야 합니다. 이 과정에서 시간이 소요되고 오류 발생의 가능성이 있으며, 잘못된 데이터로 인해 잘못된 의사결정을 내릴 수도 있습니다. 대용량 실험이 발전함에 따라 사용가능한 기기 데이터의 크게와 복잡성은 계속 증가하고 있으며, 이러한 수동적 처리가 언제까지 이용가능 할지 알 수 없습니다.

Dotmatics BioBright솔루션은 기기가 어디에 있든 기기데이터를 수집하고 처리하는 프로세스를 완전히 자동화할 수 있습니다. 결과파일들은 안전한 데이터 저장소에 보관되며 분석을 하기 위해 ELN 또는 어세이 데이터 관리시스템으로 전송됩니다. 따라서 전체적인 프로세스를 실시간으로 자동화할 수 있으며 데이터 이동에서 발생할 수 있는 오류를 없애줍니다.

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Your challenges

Dotmatics는 가능합니다.

Laptop with Bar Chart Icon

기기 파일을 실험으로 쉽게 가져옴

간단하게 클릭으로 기기 데이터와 결과를 ELN 실험으로 가져올수 있으신가요?

실험실 데이터 수집을 위해서 각각의 파일을 일일이 네트워크 드라이브 검색을 하시나요? 파일들을 USB를 이용해서 옮기시나요? 실험에 등록하기 전 파일세트를 구성한 뒤 데이터를 직접 추출하시나요?

project management icon

자동 대용량 실험 분석

대용량의 많은 실험실 데이터를 가지고 자동으로 연구기록을 생성하고 분석이 가능합니까?

결과를 결정하는데 필요한 기기데이터를 모으고 불러오기 전에 각각의 시스템에서 수동으로 실험을 만들어야만 합니까?

모든 데이터에 쉽게 접근하여 의사결정 지원

실험결과와 관련된 실험 및 기반의 모든 raw 데이터셋들을 쉽게 찾을수 있으신가요? 드릴다운(drill down)을 통해 가설검증에 필요한 데이터를 쉽게 찾으실 수 있나요?

최종 결과 데이터, 실험데이터및 raw데이터 모두 각각 별도의 데이터 사일로에 저장되어 있나요?

artificial intelligence icon

AI/ML을 위한 깨끗한 데이터 제공

AI / ML 모델을 위한 모든 데이터가 깨끗하고 데이터에 오류가 없다고 확신하십니까? 데이터를 규제 문서를 위한 주요한 증거로 사용할 계획입니까? 데이터 보관 및 관리에 대해 확신하실 수 있으신가요?

실험 기기에서부터 실험 결과를 결정하는 단계까지 사람이 직접 관여하는 프로세스가 있으신가요? 그렇다면 이 프로세스가 일관적이며 부주의로 인한 오류가 없다고 확신할 수 있으십니까?

 

 

Capabilities

Dotmatics BioBright와 함께하세요.

icon 기기데이터를 자동으로 기록 및 파싱(parsing)후 ELN으로 불러오기

  • The Dotmatics BioBright solution automatically
    • Captures instrument files
    • Extracts the data and metadata, include hidden metadata
    • Stores the raw files and results in a secure data lake
  • From the Dotmatics ELN, a scientist can browse directly into the BioBright repository
  • Selected files are loaded directly into the ELN
  • Files are processed and rendered according to type e.g. excel spreadsheets , chemical structure SDF files, sequence files …
  • Files are available via RESTFul API – automatic, secure and lossless

icon 기기에서 생성된 데이터를 읽을 때 자동으로 실험 생성 및 분석

  • The Dotmatics BioBright solution automatically
    • Captures instrument files
    • Extracts the data and metadata
    • Stores the raw files and results in a secure data lake
  • Capturing a set of files (e.g. assay results from a plate reader) automatically triggers creation of a new experiment in the assay data management system
  • Plate data is sent into the new experiment automaticall, without any human intervention required
  • Calculations such as curve fits and curve classifications are automatically triggered
  • No manual experiment creation, data loading or analysis. The assay scientist is presented with a completed experiment to review and refine
  • Files are available via RESTFul API – automatic, secure and lossless

icon 학습 및 의사결정 지원을 위한 클린 데이터 보장

  • Fully automated data processing from instrument to experiment eliminates human error and ensures clean data are feeding your AI/ML models
  • Full datasets that contain raw files, parsed data, results and analysis are easy to access for decision support and drill down
  • Datasets creation rules are customizable. Want a dataset that is automatically created based on your custom business or workflow rules, this system allows it

Products

솔루션 구현을 위한 제품 리스트

iconDarwin Sync

  • Darwin Sync client installs on PCs connected to instruments, in the cloud or at CROs
  • Encrypts files and securely uploads to the cloud
  • Direct API connections for instrument software platforms (e.g. Empower, Unicorn etc)
  • Stores files in a secure data lake on the cloud
  • Search and browse for files

iconBioBright Cloud

  • Parse and extract data and metadata from file and non-file based systems
  • Define and apply QA/QC workflows to the data
  • Build lightweight dashboards and visualization apps for operational insights
  • Rapidly integrate data into other applications via BioBright’s API-first approach (e.g. ELN, image analysis, assay data management, …)

iconDotmatics Studies Notebook

  • Flexible protocols (implemented as templates) allow the single ELN to accommodate highly structured experiments such as synthetic chemistry and protein purifications, as well as more ad hoc experiment types often useful for target identification and discovery biology experiments. Ad hoc experiments are also often used to support a transition from paper based notebooks
  • Dotmatics Studies Notebook allows for collaboration on experiments by multiple scientists within or between organizations

iconDotmatics Studies

Dotmatics Studies is a highly flexible, innovative screening data management solution to capture and analyze all types of screening experiments from high content (HCS) and high throughput (HTS) to dose-response and DMPK studies.

  • Defines analysis protocols for plate and non-plate based assays
  • Provides out-of-the-box and custom assay protocols, curve fit calculations, plate readers, and plate layouts captured and stored for re-use
  • Supports very high data volume assays
  • Defines business rules for very automated classification of results
  • Manual or automated processing allows screening scientists to apply the screening protocols to process raw instrument and validate the results, or experiment creation and processing to be driven via an automation layer.
  • Once completed and validated, screening results are immediately available via Browser to the project team

iconBrowser

Dotmatics Browser is a powerful web-based search and reporting solution that provides federated searching across Dotmatics and third party research databases, enabling research scientists to access all of their data whenever they need it, irrespective of where it is stored.

WHAT IT DOES:

  • Integrates chemical, biological, assay, notebook and other research databases to provide a single federated search and browse capability
  • Provides scientific search, such as chemical substructure and similarity
  • Manages project level and personal search forms and views, queries, lists and reports
  • Powerful scientific data visualization as forms, tables and charts.

iconVortex

Vortex is an interactive data visualization and analysis solution for scientific decision support. Building on and extending the spreadsheet paradigm, it provides the data manipulation, statistical analysis and sophisticated plotting capabilities required to explore and understand any complexity and size of data. Vortex is also scientifically aware providing native cheminformatics and bioinformatics analysis and visualizations.

WHAT IT DOES:

  • Allows users to understand, refine and select from large and/or complex data sets
  • Allows teams to collaborate on scientific analysis through shareable workspaces and reusable templates
  • Understands numeric, textual, image, chemical structure and biologic sequence data
  • Generates high performance, interactive visualizations, including charts and tables
  • Handles very large datasets – e.g. tables of millions of compounds by thousands of descriptors or cells containing whole genome sequences
  • Has inbuilt data mining, statistical, cheminformatics and bioinformatics analysis functions
  • Loads data from many types of file or when used in conjunction with Browser, directly from database