IT 조직을위한 Dotmatics

관리 가능한 R&D IT – 차이를 만드는 인프라

OVERVIEW

바른 인프라의 선택

견고한 IT 인프라는 모든 R & D 조직의 필수적인 사항입니다. 디지털화는 “데이터를 기반으로하는 혁신”같이 기업 전략에 포함되기도 하며, IT조직은 연구원이 데이터를 효율적으로 기록하고 활용할 수 있도록 유연한 시스템을 확보해야합니다. 연구는 대부분 협업으로 진행합니다. 따라서 해당 인프라는 다양한 유관 부서와 다양한 지역 걸쳐 구축될 수 있어야 하며 동시에 협업 및 아웃소싱을 지원할 수 있어야합니다. 하지만 이렇게 중요한 인프라가 각 부서마다 개별적으로 구축됐거나 인수합병 등을 통해 다른 시스템에 통합되거나 오래된 구시대적 레거시 시스템인 경우가 있어 불편하고 복잡한 경우가 많습니다.

R & D IT 시스템은 많은 비용을 필요로 하며, IT 조직의 임무는 라이센스, 유지 관리, 배포, 커스터마이징 및 구현 등의 모든 기여 비용을 고려하여 최상의 인프라를 설계하고 선택하는 것 입니다.

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CHALLENGES

Dotmatics는 가능합니다.

어떻게 확장 가능한 인프라를 제공하나요?

온프레미스, 클라우드 또는 SaaS로의 이동을 처리할 수 있으며 협업과 아웃소싱을 지원합니다. 다양한 기능을 가진 모듈을 보유하여 하나의 인터페이스로 제공하고 있기에 복잡한 패치워크 시스템을 사용하지 않습니다.

어떻게 비용을 최소화하면서 유연할 수 있나요?

커스터마이징을 최소화 합니다. 기존 인프라를 사용하여 새로운 워크플로우와 역할을 구현합니다. 접근이 어려운 데이터 사일로로부터 데이터 기반 연구를 지원합니다.

어떻게 기능을 유지하면서 복잡한 랜드스케이프를 통합할 수 있나요?

전면교체 하지않고 기술 부채를 제거합니다. 연구원들이 시스템에 저장된 데이터에 접근할 수 있도록 하면서 기존의 레거시 시스템을 단계적으로 정리할 수 있습니다.

CAPABILITIES

Dotmatics와 함께하세요.

icon 통합 플랫폼 접근의 이점을 활용

Dotmatics는 R & D IT에 대한 플랫폼을 활용하여 유연하고 구성 가능한 워크플로우와 역할을 효율적으로 활용할 수 잇도록 합니다. 개방형 플랫폼으로써 데이터 소스를 통합하고, 공통적 데이터 모델에 대해 데이터를 표준화하고, 공동 작업 및 결과 공유를 방해하지 않고 지적재산권을 보호 할 수 있는 보안 체계를 적용 할 수 있습니다. 당사의 플랫폼은 커스터마이징이 아닌 환경설정을 통해 이러한 것들을 지원하므로 유지 관리 및 서비스가 쉬운 인프라를 제공합니다.

icon TCO 최소화 – 적은 비용으로 더 많은 일을!

Dotmatics 플랫폼은 온프레미스, 프라이빗 클라우드 또는 SaaS 인프라로 사용할 수 잇습니다. 각 시나리오는 동일한 코드베이스를 사용하기 때문에 특정 시나리오에 얽매이지 않습니다. 즉, 온프레미스에서 클라우드로의 이동, 또는 그 반대의 경우 등 기업의 환경 변화에 대해 어떤 경우라도 미리 대비를 할 수 있습니다. Dotmatics는 커스터마이즈가 아닌 단일 코드 베이스 구성으로 모든 고객을 지원하기 때문에 업그레이드가 대폭 간소화됩니다.

icon 도입과 유지 보수를 간소화

많은 기관에서 IT인프라를 클라우드로 이동하려는 경향이 증가하고 있지만 R&D IT의 옵션의 한계로  상호운용성, 확장성, 가용성 및 잠재된 고유한 문제가 발생하고 있습니다.

Dotmatics는 Dotmatics에서 지원하는 AWS 인스턴스를 SaaS 시스템으로 실행하는 옵션을 사용하여 이 문제를 해결합니다. Dotmatics는 8년 이상 AWS를 사용해왔으며, 300개가 넘는 단일 테넌트 고객 인스턴스를 운영하며 180TB 이상의 데이터를 관리하고 있습니다. 신규 고객의 절반 이상이 시스템을 SaaS로 운영하는 것을 선택하고 있습니다.

icon 커스터마이징 혹은 다수의 업체가 엮인 복잡한 랜드스케이프 불필요

R&D IT의 주요 과제 중 하나는 복잡한 과학 데이터와 애플리케이션 요구사항을 어떻게 지원하느냐입니다. 기업에서 각 부서가 최선의 애플리케이션을 선택하든지, 커스터마이징 프로젝트를 진행하든지  IT 부서에서는 부담이 될 수 밖에 없습니다.

Dotmatics 플랫폼은 연결된 모든 데이터소스, 기본적 Dotmatics, 자체 개발 혹은 웹소스를 포함한 타사의  데이터에 접근 할 수 있습니다. 애플리케이션 수준에서 타사의 애플리케이션에 접속할 수 있으며 워크플로우 통합과 원활한 데이터 교환이 가능합니다.

icon 전면교체(rip-and-replace) 불필요

처음부터 R&D IT 인프라가 완벽하게 설계되는 경우는 거의 없습니다. 따라서 레거시 애플리케이션과 데이터를 처리하기 위한 전략을 찾아야 합니다.  시스템의 전면교체(rip-and-replace)전략은 기술적으로 실현이 가능하지만 심각한 변경 관리에 문제를 야기할 수 있습니다.

Dotmatics 플랫폼은 기존 시스템 위에 데이터 인텔리전스 인프라를 배치하여 이러한 문제를 해결합니다. 이를 통해 과학 데이터를 통합하고 컨텍스트화되어 기계학습(ML) 및 인공지능(AI) 애플리케이션 등 과학 데이터 마이닝 및 데이터  기반의 R&D를 지원합니다. 데이터 연합 (Data Federation)으로 IT부서는 레거시 시스템에서 최신 인프라로의 원활하게 전환할 수 있는 시스템을 구현할 수 있습니다.

icon 새로운 과학을 따라가다

과학은 항상 진화하고 있습니다. 때문에 과학자는 항상 새로운 기능과 데이터 액세스 옵션을 요구할 것이며  이를 R&D IT 시스템에 포함시켜야 합니다.

Dotmatics는 과학자들이 항상 모든 데이터에 접근할 수 있도록 해야 한다는 생각을 기반에 두고 있습니다.  데이터 연합 (Data Federation)과 데이터 시각화는 당사 전략의 핵심 구성요소로 실험실 자동화와 역할 기반의 워크플로우 기능을 구현합니다. Dotmatics는 고객과의 협력을 통해 지속적으로 혁신하고 있습니다. 최근의 사례로 메타데이터 프레임워크, 생물학적제제 및 비특이적 엔티티의 엔티티 작성/등록, 단일 실험 내에서의 다양한 분석 지원, 마이닝 반응 경로 정보에 대한 그래프 분석 등이 있습니다.

Products

솔루션 구현을 위한 제품 리스트

iconDotmatics Browser

Dotmatics Browser는 강력한 웹기반 검색 및 리포팅 솔루션으로 Dotmatics 및 타사의 연구 데이터베이스에서 통합 검색을 제공하여 연구원들이 필요할 때 언제든 데이터 저장 위치에 상관없이 모든 데이터에 접근할 수 있습니다.

Browser로 무엇을 할 수 있나요?

  • 화학, 생물, 어세이, 연구노트 및 기타 연구 데이터베이스를 통합하여 단일 화면에 통합 검색 및 탐색 기능을 제공합니다.
  • 화학 구조의 하부 구조 및 유사성 같은 과학적 검색을 제공합니다.
  • 프로젝트 수준 및 개인에 따른 검색 양식 및 보기, 검색 내역, 목록 및 보고서를 관리합니다.
  • 양식, 표 및 차트로 강력한 데이터 시각화를 구현합니다.

iconDotmatics Cloud

모바일 기술은 이동중에도 협업할 수 있으며, 데이터에 액세스하고 의사결정이 가능하기에 처리량을 증가시키고 검토 과정에 소요되는 시간을 줄여줍니다. 클라우드에서 실행하는 Dotmatics Platform은 다양한 시스템과 데이터 소스를 통합할 수 있습니다. Dotmatics Platform 고객들은 클라우드에서 실행되는 자체 인스턴스의 웹브라우저를 이용하여 모든 Dotmatics 솔루션으로 안전하게 액세스가 가능합니다. 이를 통해 사용자는 관련된 모든 내용을 포함한 정보를 볼 수 있으며, 이를 통해 정보에 입각한 연구와 비즈니스에 관련 의사결정이 가능합니다.

클라우드상의 Dotmatics Platform은 Amazon Web Services™(AWS)에 의해 구동됩니다. Gold standard인 AWS 인프라를 사용으로 데이터 보안을 보장합니다. Dotmatics의 솔루션은 전 세계의 Amazon이 관리하는 데이터 센터에 설치되어 사용자의 사용자가 원하는 위치에 데이터가 저장됩니다. Dotmatics 플랫폼은 다양한 분야의 그룹의 모든 과학데이터와 기능에 접근하기 위한 단일 액세스 지점을 제공합니다. 과학자, 공동 작업자 및 파트너는 위치나 시간에 관계없이 클라우드를 통해 서로 즉시 같은 데이터를 가지고 상호 소통을 통한 실시간으로 연구에 관한 약속을 이행할 수 있습니다.

Cloud로 무엇을 할 수 있나요?

  • 각각의 고객 데이터는 별도의 전용 인스턴스에 보관
  • 인스턴스에 대한 액세스는 듀개의 방화벽 레이어와 사용자 인증으로 제어
  • 인스턴스와의 모든 트래픽은 2048 비트 GlobalSign 인증서를 사용하여 암호화된 HTTPS / SSL
  • 모든 인스턴스는 중앙에서 관리되는 Trend Micro Antivirus 소프트웨어를 실행

공동 연구의 핵심

  • Dotmatics 플랫폼과 결합된 Dotmatics Cloud는 공동 연구 수행 방식을 혁신
  • Dotmatics의 유연하고 포괄적인 플랫폼은 프로젝트 사용자에게 안전한 액세스를 제공합니다
  • 단순한 파일 공유뿐만 아닌 아이디어 생성 솔루션
  • 전 세계의 내부 및 외부 연구개발팀이 데이터를 공유하고 새로운 이슈를 제기하며 혁신적인 아이디어와 지적재산을 창출

iconDotmatics Platform

Dotmatics Platform은 Dotmatics의 웹기반의 과학 애플리케이션을 지원하하고 이들이 함께 작동하여 사용자에게 원활한 end-to-end 워크플로우를 제공하는 공통 프레임워크입니다. Platform은 클라우드에서 관리하는 배포나 자온프레미스에서 체지원해야하는 배포를 지원한다. 개방형 아키텍처를 통해 워크플로우에 타사의 소르트웨어를 통합할 수도 있습니다. Platform을 “Dotmatics Browser”와 함께 사용하면 기업 및 외부 연구 데이터에 관한 연합 데이터로 할 수 있습니다. Dotmatics Platform은 완전히 통합되어 각각의 애플리케이션의 기능을 포괄하는 비즈니스 워크플로우를 지원하기 위해 공통적 데이터 모델이나 코드 및 아키텍처를 제공합니다. 이는 유지보수 및 개발에 있어 용이하고, 연구기관의 확장에 있어서도 중요합니다. 이를 통해 여러 개발이력을 다양한 개발이력을 가진 여러 테크놀로지 및 아키텍처와 긴밀하게 통합되지 않은 어플리케이션을 지원하는 다른 플랫폼과 비교할 경우 총소유비용(TCO)을 최소화할 수 있습니다.

 

  • 모든 Dotmatics의 웹 기반 과학 애플리케이션을 지원하는 프레임워크를 제공하고 서로 연동하여 원활한 워크 플로우를 제공
  • 관리자가 사용자 및 그룹, 애플리케이션 및 구성을 관리 할 수 있는 포털
  • 타사 소프트웨어와의 자동화 및 통합을 위한 API를 제공​
  • Dotmatics Browser와 함께 사용하면 조직 전체 및 외부의 데이터에 액세스 가능

iconDotmatics Studies Notebook

Dotmatics Studies Notebook is an Electronic Laboratory Notebook (ELN) with flexible templating to capture, store and search experiments from all scientific disciplines.

  • Flexible protocols (implemented as templates) allow the single ELN to accommodate highly structured experiments such as synthetic chemistry and protein purifications, as well as more ad hoc experiment types often useful for target identification and discovery biology experiments. Ad hoc experiments are also often used to support a transition from paper based notebooks
  • Dotmatics Studies Notebook allows for collaboration on experiments by multiple scientists within or between organizations

iconDotmatics Studies

Dotmatics Studies is a highly flexible, innovative screening data management solution to capture and analyze all types of screening experiments from high content (HCS) and high throughput (HTS) to dose-response and DMPK studies.

  • Defines analysis protocols for plate and non-plate based assays
  • Provides out-of-the-box and custom assay protocols, curve fit calculations, plate readers, and plate layouts captured and stored for re-use
  • Supports very high data volume assays
  • Defines business rules for very automated classification of results
  • Manual or automated processing allows screening scientists to apply the screening protocols to process raw instrument and validate the results, or experiment creation and processing to be driven via an automation layer.
  • Once completed and validated, screening results are immediately available via Browser to the project team

iconDotmatics Cascade

Dotmatics Cascade manages the requesting and assignment of laboratory tasks, and tracking the progression of samples, across multiple teams within an organization or across a collaborating network.

  • Dotmatics Cascade allows organizations to define available services, such as assay execution or analysis and the associated scientific team
  • Scientists create requests for services and submit compounds Service managers manage, group and assign requests for execution
  • Service team scientists accept requests, create and auto populate experiments to execute them
  • Teams can see request status and monitor compound or sample progression

iconDotmatics Chemselector

Dotmatics Chemselector manages very large chemistry datasets with fast search and trivially simple maintenance/update. It has a modern user interface focused on browsing and filtering for molecule, reagent and sample selection. The available eMolecules+ for Chemselector dataset provides access to highly curated eMolecules sourcing data.

Chemselector

  • High performance chemical searching, filtering and selection designed to support critical medicinal and synthetic chemistry workflows including:
    • building block selection
    • fragment set design
    • screening molecule selection for scaffold hopping
    • chemical series validation for hit to lead campaigns (“SAR by catalog”)
  • Uses Dotmatics provided datasets such as eMolecules+ for Chemselector and ChEMBL for Chemselector, or datasets built in-house from corporate or public databases

eMolecules for Chemselector

  • A sourcing dataset of over 20 million compounds and 8 million unique chemical substances with availability, pricing and packaging information from hundreds of suppliers using data curated by eMolecules
  • Provides additional information to the eMolecules source data to enhance searching, including deprotected structures, calculated physicochemical properties and structure classes
  • Simple monthly updates provide the latest eMolecules supplier and catalog data

iconDotmatics for Office | D4O

Dotmatics for Office makes Microsoft™ Office® applications such as Excel®, PowerPoint®, Word, OneNote and Outlook® chemically aware.

  • Adds live chemistry to documents, emails, spreadsheets and presentations
  • Works with Dotmatics Browser to retrieve chemistry and associated scientific data from databases directly into Microsoft Office applications
  • Provides property calculations, searching, enumeration and r-group analysis on the live structures in Excel

iconDotmatics Elemental

Dotmatics Elemental is a chemical sketcher that enable scientists to draw, edit and save structures and reactions, and calculate properties.

  • Sketch molecules, reactions and structure queries
  • Calculate chemical properties
  • Available as a fully-featured desktop application, iOS app or lightweight JavaScript plugin for sketching in-line in webpages

iconDotmatics Gateway

Dotmatics Gateway is a scientific document management solution that serves as a central place to share project documents and associated information across an internal or externalized team. It provides discussion threads and project events feeds.

  • Stores and shares project documents such as reports, presentations and literature
  • Provides news feeds detailing the latest documents and project results
  • Provides discussion threads associated with documents and project events
  • Complements structured project databases such as the molecule registry or assay results databases

iconDotmatics Inventory

Dotmatics Inventory is a fully searchable sample and materials inventory that tracks chemicals, biologics, instruments and associated data across a hierarchy of locations and manages the dispensing and plating workflows, as samples are moved through an R&D process.

  • Defines a hierarchy of storage locations for an organization
  • Track samples in containers such as bottles and plates in those storage locations
  • Manages research materials, reagents and assets
  • Manages the aliquoting and dispensing workflows to distribute samples for testing
  • Maintains a full audit trail
  • Allows for searching and reporting on inventory information alongside other corporate data

iconDotmatics Nucleus

Dotmatics Nucleus is a straightforward solution for importing flat files, such as spreadsheets, into a database.

Easily upload data from a variety of sources ready for query and reporting in Dotmatics Browser.

iconDotmatics Pinpoint

Dotmatics Pinpoint is a chemical cartridge for indexing and searching chemistry within Oracle databases.

Pinpoint enables indexing of chemical structures, calculations of physical chemical properties and substructure searches within an Oracle database. It is used to support structure searching with Dotmatics Browser, check for structural uniqueness and register molecules in Dotmatics Register, and store and search chemical reactions in Dotmatics Studies Notebook.

iconDotmatics Reaction Workflows

Reaction Workflows is a graphical environment that enables scientists to build and execute data processing workflows to perform common cheminformatics tasks, such as library enumeration, structure normalization and compound profiling. Users build workflows in a drag-and-drop environment by selecting and connecting nodes that provide inputs (e.g a list of reagents) and outputs (e.g. view in Dotmatics Vortex) or perform actions (e.g. perform a reaction), configuring them with data and then executing the workflow to produce results. Many different tasks can be configured including:

  • Synthetic library enumeration for an ELN experiment
  • Virtual library enumeration and profiling for virtual screening
  • Structure normalization for registration
  • Idea generation via lead hopping or to avoid liabilities
  • Chemistry file clean up

iconDotmatics Register

Dotmatics Register is a web-based compound and batch registration system used to maintain corporate chemical registration and reagent databases.

  • Captures chemical structure and associated data for newly synthesized or acquired compounds
  • Determines uniqueness and assigns new corporate IDs and/or new batch/lot IDs
  • Allows for single compound or batch registration
  • Allows registration from its own UI or from an ELN (Dotmatics or third party)

iconDotmatics Vortex

Dotmatics Vortex is an interactive data visualization and analysis solution for scientific decision support. Building on and extending the spreadsheet paradigm, it provides the data manipulation, statistical analysis and sophisticated plotting capabilities required to explore and understand any complexity and size of data. Vortex is also scientifically aware providing native cheminformatics and bioinformatics analysis and visualizations.

  • Allows users to understand, refine and select from large and/or complex data sets
  • Allows teams to collaborate on scientific analysis through shareable workspaces and reusable templates
  • Understands numeric, textual, image, chemical structure and biologic sequence data
  • Generates high performance, interactive visualizations, including charts and tables
  • Handles very large datasets – e.g. tables of millions of compounds by thousands of descriptors or cells containing whole genome sequences
  • Has inbuilt data mining, statistical, cheminformatics and bioinformatics analysis functions
  • Loads data from many types of file or when used in conjunction with Browser, directly from databases