Dotmatics 항체 신약개발 솔루션

항체 기반의 치료 프로그램을 진전시키는데 필요한 정보 제공

OVERVIEW

항체 신약개발을 위한 정보학 솔루션

항체는 의약품 시장을 선도하는 약물로 다양한 질병의 치료 방안이 되고 있습니다. 기존에 알려진 형태의 항체 치료제 외에도  이중특이성(biscepcific) 및 삼중특이성(trispecific), 항체약물복합체(ADC) 및 융합단백질 등 다양한 변형된 항체들이 있습니다. 이러한 항체의 다양성은 혁신을 위한 다양한 기회를 제공합니다. 하지만 동시에 항체 연구 데이터 관리와 해석에도 어려움을 겪고 있습니다. 항체 신약개발을 위한 Dotmatics 솔루션을 통해 실험을 간소화하며, 연구를 지원합니다.

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CHALLENGES

Dotmatics는 가능합니다.

DNA Sequence Icon

Sanger나 NGS 시퀀스 데이터를 쉽게 분석하고 annotation할 수 있습니까?

항체 치료제 개발은 면역 프로토콜과 단백질 생산 워크플로우 등의 일반적인 워크플로우를 포함합니다. 그러나 약물 후보물질을 정제하고 안전성과 효능을  조정하기 위해서 과학적 혁신도 필요합니다.

DNA to Table Icon

항체 후보물질 설계 및 선택의 최적화를 위해 실험정보와 sequence 정보를 연계시켜 확인할 수 있습니까?

항체 치료제의 효과에는 많은 요인들이 관여합니다. Dotmatics 솔루션은 실험 데이터와 후보물질의 sequence를 함께 확인이 가능하여 sequence variation에 대한 효과나 타겟 mutation에 대해 고려하며 후보물질을 최적화 할 수 있습니다.

DNA Icon

언제든지 데이터를 확인할 수 있습니까?

항체 신약개발 프로젝트에서는 방대한 양의 다양한 데이터를 생성됩니다. 이로인해 데이터 관리, 특히 후보물질 간 관계 추적에 문제가 발생할 수 있습니다. 정보 기반의 의사결정을 위해 모든 프로젝트 데이터를 확인하는 것이 중요합니다.

과학적 혁신을 보호할 수 있습니까?

신약개발업계의 경쟁은 치열합니다. 많은 기업들이 같은 치료 분야를 타깃으로 하고 있습니다. 항체의 설계와 실험 과정에서의 혁신은 매우 중요한 자산이기에 엄격하게 보호해야 합니다.

CAPABILITIES

Dotmatics와 함께하세요.

icon Sequence 데이터의 분석 및 시각화

사용이 간편한 Dotmatics 솔루션을 통해 sequence 분석 작업을 수행할 수 있습니다. Sanger 또는 NGS sequence 데이터는 ‘Geneious Biologics’를 사용하여 같은 작업 공간에서 데이터를 불러올 수 있으며, assembly, annotation과 분석 작업 등을 수행할 수 있습니다. 표준화된 도구를 통해 고품질 데이터와 신뢰할 수 있는 결과를 보여줍니다.

 

icon 후보물질 설계 및 최적화를 위한 sequence와 실험데이터의 연계

과학적 지식과 전문성을 적용하려면 데이터에 접근하여 관련 정보를 확인하고 결론을 도출할 수 있어야 합니다. ‘Geneious Biologics‘는 하나의 화면에서 실험 데이터와 항체 sequence 데이터를 나란히 볼 수 있어 관련 정보들을 한 눈에 파악할 수 있습니다. 어떤 sequence motif가 생물물리적 특성에 관여하는지 확인하고, 최적의 후보물질을 선택한 다음 sequence 최적화합니다.

icon 연구 데이터를 기록할 수 있습니다.

Dotmatics 솔루션은 연구 데이터를 기록에 있어 연구원의 요구를 만족시킵니다. 면역 프로토콜이나 단백질 생산 워크플로우 등의 일반적인 워크플로우를 이용할 수 있습니다. 하지만 새로운 연구를 위해서 더 많은 특별한 계획 없이 수행되는 임시의(Ad hoc) 조사들이 필요할 수도 있습니다. Dotmatics 솔루션은 이러한 부분도 지원하고 있습니다. 디지털로의 기록은 최고 품질의 데이터를 보증하며 신속하게 연구를 진행할 수 있도록 도와줍니다. Dotmatics의 전자 연구 노트(ELN)인 Studies Notebook이 이러한 과정을 관리합니다.

icon 언제든지 모든 프로젝트 데이터를 확인할 수 있습니다.

데이터를 해석하고 충분한 정보에 입각한 결정을 내리기 위해서는 항체 데이터의 전체 그림을 확인할 수 있어야 합니다. Dotmatics Browser는 필요한 정보를 알기 쉽게 화면에 보여줌으로써 이를 가능하게 합니다. 결과를 쉽게 검색하고 찾아볼 수 있기 때문에 과학적인 전문지식을 간편하게 적용할 수 있습니다. Dotmatics Vortex를 사용하면 CDR(Complementarity-determining region)에 annotation되어 있는 heavy chain, light chain이나 다른 중요한 motif의 sequence 확인할 수 있습니다. 후보물질을 최적화를 위한 가정을 한 실험에서 돌연변이 영향을 테스트할 수 있습니다.

icon 엔티티를 등록하고, 관계 추적 및 지적재산을 보호할 수 있습니다.

항체 개발은 heavy chain과 light chain 의 최적화된 적절한 조합을 찾아야 하는데, 이는 후보 약물중 적절한 치료약물을 찾기 위한 과정입니다. 이러한 혁신적 연구와 그 과정에 대한 데이터는 Dotmatics Bioregister에 의해서 보호됩니다. 이를 통해 연구원들의 데이터 접근을 제한하지 않고도 조직의 지적재산(IP)을 엄격하게 보호할 수 있습니다.

Products

솔루션 구현을 위한 제품 리스트

iconGeneious Biologics

Geneious Biologics is a cloud-based software solution for screening antibodies and antibody-like sequences. Geneious Biologics allows you to analyze and explore your integrated datasets via an interactive and easy-to-use web interface. We take care of the data wrangling, so you can focus on the science.

  • Annotate and validate your sequences with our configurable, accurate, and scalable analytics pipelines
  • Explore powerful visualisations, clustering, and search tools to gain valuable insights from your sequences
  • Significantly speed up candidate selection by leveraging datasets of all sizes, from Sanger to NGS to Single Cell
  • Transform data management and streamline processes in a secure and shareable cloud environment

iconDotmatics Browser

Dotmatics Browser는 강력한 웹기반 검색 및 리포팅 솔루션으로 Dotmatics 및 타사의 연구 데이터베이스에서 통합 검색을 제공하여 연구원들이 필요할 때 언제든 데이터 저장 위치에 상관없이 모든 데이터에 접근할 수 있습니다.

Browser로 무엇을 할 수 있나요?

  • 화학, 생물, 어세이, 연구노트 및 기타 연구 데이터베이스를 통합하여 단일 화면에 통합 검색 및 탐색 기능을 제공합니다.
  • 화학 구조의 하부 구조 및 유사성 같은 과학적 검색을 제공합니다.
  • 프로젝트 수준 및 개인에 따른 검색 양식 및 보기, 검색 내역, 목록 및 보고서를 관리합니다.
  • 양식, 표 및 차트로 강력한 데이터 시각화를 구현합니다.

iconDotmatics Studies Notebook

Dotmatics Studies Notebook (ELN)은 모든 과학 분야의 실험 데이터 수집, 저장 및 검색 할 수 있는 유연한 템플릿 기반 전자 연구 노트 (ELN)입니다.

Studies Notebook으로 무엇을 할 수 있나요?

  • 연구원들은 Dotmatics Studies Notebook을 사용하여 모든 팀원이 쉽게 검색 할 수 있는 형태로 실험 데이터를 수집하고 저장할 수 있습니다. 또한, Dotmatics Studies Notebook 을 통해 지적재산권 보호 및 감사 오딧을 하고 서명 절차를 정의 할 수 있습니다.​
  • 템플릿으로 구현되는 유연한 프로토콜을 통해 합성 화학 및 단백질 정제와 같은 고도로 구조화 된 실험 뿐만 아니라 생물학 실험을 통한 표적 식별 및 개발에서 유용한 ad-hoc 형태의 실험을 수용합니다. Ad-hoc은 종이 기반 연구노트에서 전자연구노트로 전환시에 종종 사용됩니다.​
  • Dotmatics Studies Notebook을 사용하면 조직 내 혹은 조직의 여러 연구원이 공동 연구를 수행 할 수 있습니다.​

iconDotmatics Bioregister

Dotmatics의 Bioregister는 시퀀스 기반 및 화학적 변형 생물물질이나 구조가 없는 생물학적 엔티티 등록을 위한 웹 기반 응용 프로그램으로, 생물물질 신약개발 기관이 연구 엔티티 고유성을 보장하고 지적 재산을 보호 할 수 있습니다. Bioregister는 DNA, RNA, 펩타이드 및 단백질, 항체, conjugate, non-natural 펩타이드 및 뉴클레오티드, 플라스미드, 세포주 및 사용자가 정의 엔티티를 포함한 광범위한 생물 제제 엔티티들을 관리합니다. ​또한, 사용자는 정제 및 발현 정보,  기타 단백질 생산 데이터의 배치(batch) 및 샘플을 기록 할 수 있습니다.

Bioregister로 무엇을 할 수 있나요?

  • 화학적으로 변형된 sequence 및 sequence가 없는 물질, 관련 속성 데이터 및 계보를 포함한 생물학적 물질을 기록하고 관리합니다.​
  • 자연 및 비자연 엔티티의 화학적 표현 (가능한 경우)을 생성합니다.​
  • 엔티티의 고유성을 결정하고 등록 번호를 할당합니다.​
  • 단백질 발현, 정제 및 특성화와 같은 엔티티 생성과 관련된 데이터를 관리합니다.​
  • 완전한 관계 추적을 통해 엔티티에 대해 생성된 단백질의 배치(batch) 및 샘플을 기록합니다.

iconDotmatics Platform

Dotmatics Platform은 Dotmatics의 웹기반의 과학 애플리케이션을 지원하하고 이들이 함께 작동하여 사용자에게 원활한 end-to-end 워크플로우를 제공하는 공통 프레임워크입니다. Platform은 클라우드에서 관리하는 배포나 자온프레미스에서 체지원해야하는 배포를 지원한다. 개방형 아키텍처를 통해 워크플로우에 타사의 소르트웨어를 통합할 수도 있습니다. Platform을 “Dotmatics Browser”와 함께 사용하면 기업 및 외부 연구 데이터에 관한 연합 데이터로 할 수 있습니다. Dotmatics Platform은 완전히 통합되어 각각의 애플리케이션의 기능을 포괄하는 비즈니스 워크플로우를 지원하기 위해 공통적 데이터 모델이나 코드 및 아키텍처를 제공합니다. 이는 유지보수 및 개발에 있어 용이하고, 연구기관의 확장에 있어서도 중요합니다. 이를 통해 여러 개발이력을 다양한 개발이력을 가진 여러 테크놀로지 및 아키텍처와 긴밀하게 통합되지 않은 어플리케이션을 지원하는 다른 플랫폼과 비교할 경우 총소유비용(TCO)을 최소화할 수 있습니다.

 

  • 모든 Dotmatics의 웹 기반 과학 애플리케이션을 지원하는 프레임워크를 제공하고 서로 연동하여 원활한 워크 플로우를 제공
  • 관리자가 사용자 및 그룹, 애플리케이션 및 구성을 관리 할 수 있는 포털
  • 타사 소프트웨어와의 자동화 및 통합을 위한 API를 제공​
  • Dotmatics Browser와 함께 사용하면 조직 전체 및 외부의 데이터에 액세스 가능

iconDotmatics Studies

Dotmatics Studies는 매우 유연하고 혁신적인 스크리닝 데이터 관리 솔루션으로, HCS 및 HTS에서 용량 반응 (dose-response) 및 DMPK 연구에 이르기까지 모든 유형의 스크리닝 실험을 저장하고 분석합니다.

Studies로 무엇을 할 수 있나요?

  • Plate 및 non-plate 기반 어세이에 대한 분석 프로토콜을 정의​
  • 즉시 사용 가능하(OOTB)거나 사용자 맞춤의 어세이 프로토콜, Curve fit 계산, Plate reader 및 기록 및 저장시 재사용 할 수 있는 plate 레이아웃을 제공​
  • 많은 양의 데이터 어세이도 지원합니다.​
  • 결과 분류의 자동화를 위한 비즈니스 규칙을 정의​
  • 수동 또는 자동 처리를 통해 스크리닝 분석하는 연구원은 스크리닝 프로토콜을 적용하여 기기의 raw 데이터를 처리하고 결과를 검증하거나 실험 생성 및 처리를 자동화 레이어를 통해 구동
  • 분석을 완료되고 검증이 끝나면, 검색 결과는 Browser를 통해 프로젝트 팀에게 즉시 제공됩니다.​

iconDotmatics Platform

The Dotmatics Platform is the common framework that supports the Dotmatics web-based scientific applications and allows them to work together to provide users seamless end-to-end workflows. The Platform supports managed deployments in the Cloud or self-supported deployments on premise. An open architecture enables workflows to include third-party software integration. When used together with Dotmatics Browser the Platform allows federated data access across corporate and external research data.The Dotmatics Platform is completely unified – it provides common data models, code and architecture to support business workflows that span the capabilities of the individual applications. This is important for enterprise enablement of research organizations, providing ease of maintenance and development. It gives the lowest possible total cost of ownership compared to platforms that support their applications with less tightly integrated collections of multiple technologies and/or architectures with multiple development histories.

  • Provides the framework that supports all Dotmatics web-based scientific applications and allows them to work together to provide seamless workflows.
  • Portal for administrators to manage users and groups, applications and configurations
  • Provides APIs for automation and integration with 3rd party software
  • When used in conjunction with Dotmatics Browser provide access to data from across an organization and externally

iconDotmatics Inventory

Dotmatics Inventory is a fully searchable sample and materials inventory that tracks chemicals, biologics, instruments and associated data across a hierarchy of locations and manages the dispensing and plating workflows, as samples are moved through an R&D process.

  • Defines a hierarchy of storage locations for an organization
  • Track samples in containers such as bottles and plates in those storage locations
  • Manages research materials, reagents and assets
  • Manages the aliquoting and dispensing workflows to distribute samples for testing
  • Maintains a full audit trail
  • Allows for searching and reporting on inventory information alongside other corporate data

iconDotmatics Cascade

Dotmatics Cascade manages the requesting and assignment of laboratory tasks, and tracking the progression of samples, across multiple teams within an organization or across a collaborating network.

  • Dotmatics Cascade allows organizations to define available services, such as assay execution or analysis and the associated scientific team
  • Scientists create requests for services and submit compounds Service managers manage, group and assign requests for execution
  • Service team scientists accept requests, create and autopopulate experiments to execute them
  • Teams can see request status and monitor compound or sample progression