화합물 연구(Chemistry Design)

화학자 스스로 하는 데이터 분석과 연구

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개요

저분자 약물개발에서 데이터를 기반으로한 의사결정 촉진

저분자 약물개발 프로세스는 데이터 주도적(data-driven)으로 변하고 있습니다. Chemical series 연구개발에서 과학 데이터 분석을 통한 의사결정은 중요합니다. 화학연구를 위한 Dotmatics 솔루션은 의약화학자 및 합성화학자들에게 기초부터 설계된 분석도구를 제공하여 최선의 결정을 내리는 데 도움을 줍니다. 또한 데이터 과학자와 계산 화학자들의 부담을 덜어주어 연구개발 프로세스를 효율적으로 진행할 수 있습니다.

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당신이 필요로 할

화학자를 위한 소프트웨어가 필요하세요?

대부분의 경우 시각화 및 분석 도구는 데이터 과학자나 계산화학자용으로 설계되어 있습니다. 기능적으로는 강력하지만, 전문지식을 요구하기에 전문가 외에는 사용이 제한적입니다. 데이터에 기반한 의사 결정은 가능하지만 데이터 전문가들이 순서대로 일을 처리하기에 차례가 올 때까지 기다려야 하거나 차례가 오더라도 데이터나 분석이 완벽하지 않을수도 있습니다. 화학자가 직접 사용하기 위해서 설계된 솔루션은, 최상의 정보와 원할때 분석이 가능하여 최적의 의사결정을 지원할 수 있습니다.

원활한 워크플로우가 필요하세요?

합성 단계부터 다음 단계까지 프로젝트의 모든 SAR 데이터 수집 및 정리, 시각화와 분석, 의사 결정에 대한 모델 적용, 분자 또는 라이브러리 설계 등 중요한 다양한 업무가 있습니다. 화학자는 각 업무에 맞는 여러 각각의 애플리케이션을 사용하거나 프로그램 간에 데이터를 일일이 불러올 필요 없이 하나의 원활한 워크플로우를 통해 모든 업무가 가능합니다.

실시간의 데이터 기반 의사결정이 필요하세요?

프로젝트의 회의와 보고서는 대부분 프로젝트 데이터의 정적 스냅샷에 기초합니다.이는 급속도로 낡아 보통 수동으로 조립되기 때문에 오류가 발생하기 쉽습니다.프로젝트팀의 모든구성원은 데이터리뷰와 의사결정과정 전체를 통해 모든 프로젝트 데이터에 실시간으로 접근할 수 있어야합니다.

능력

Dotmatics와 함께하세요.

icon 연관있는 프로젝트 데이터 조합

데이터 분석에서 가장 어려운 과제 중 하나는 프로젝트 데이터셋을 수집하는 것입니다. Dotmatics 검색 기능을 사용하면 프로젝트 연구원들은 Dotmatics 데이터베이스나 다른 타사의 시스템, 혹은 사내 데이터 마트나 데이터 웨어하우스나 관계없이 모든 관련 프로젝트 데이터를 검색하고 수집 할 수 있습니다.

검색 기능을 사용하면 여러 애플리케이션에서 수집 된 데이터를 일일이 결합 할 필요없이 분석을 위해 모든 관련 프로젝트 데이터를 조합 할 수 있으므로 분석 전 데이터 관련 오류가 발생하지 않습니다. 검색쿼리는 요청시 실행되며, 표준 프로젝트 쿼리를 정의할 수 있고, 자동화된 일정에 따라 실행하여 최신 데이터를 확인 할 수 있습니다.

icon 간단한 웹 어플리케이션 가이드를 통해 프로젝트 데이터의 시각화와 분석이 가능

Dotmatics 솔루션의 핵심은 웹 사용자 인터페이스의 마법사(wizard)를 제공하는 시각화 및 화학정보학 애플리에이션이라는 점입니다. 이는 데이터 분석툴에 매일, 하루종일 매달려있는 데이터분석 전문가가 아닌 연구원들을 위해 설계되었습니다. Dotmatics 솔루션은 다음과 같은 기능을 제공합니다.

  • 분자 데이터를 탐색하도록 설계된 차트, 표 및 그리드를 통해 과학데이터의 상호적 시각화가 가능합니다.
  • property 계산과 프로그램 지표(metrics)에서 R 그룹 분석과 match-molecular pairs analysis(MMPA)까지 화학정보학 분석을 위해 신중하게 선별된 중요한 워크플로우들로 구성되어 있습니다. 각 워크플로우는 마법사(wizard)를 통해 사용자가 단계별로 분석을 하고 결과를 볼 수 있도록 구성되어 있습니다.
  • 어플리케이션을 통하여 작업이나 데이터셋, 분석을 공유할 수 있으며, 모든 팀원들이 동일한 데이터에서 작업하고 분석할 수 있으며 이를 통해 팀 기반의 의사결정이 가능합니다.

Dotmatics Blueprint에 대해 더 알아보기

icon 새로운 분자나 라이브러리를 설계하거나 구매가능한 화합물이나 라이브러리를 선택

화학자는 대화형(interactive) 설계환경을 통해 워크플로우를 구축하고 실행하여 다음과 같은 작업을 수행할 수 있습니다.

  • 합성 라이브러리를 디자인 및 enumeration하고  Notebook에서 자동으로 실험(experiment)을 생성
  • 프로파일링, 셀렉션 및 가상 스크리닝을 위한 가상 라이브러리 enumeration
  • lead hopping에서 새로운 분자를 제안을 위한 화학적 변형의 사용

Dotmatics는 빠른 화학적 검색 지원하여 방대한 데이터베이스에서 (예 : e-Molecule) 라이브러리 enumeration에 사용가능한 시약 세트를 빠르게 확인할 수 있습니다. 동일한 기능을 이용하여 상업적으로 이용가능한 스크리닝 화합물들을 필터링하여 기업에서 더 다양한 화합물을 보유를 위한 목적이나 프로젝트를 위해 알려진 SAR 특성을 확장할 수 있습니다.

icon End-to-end 워크플로우

모든 프로젝트 데이터를 수집한 뒤 분석 어플리케이션에 데이터를 가져오기에 이르기가지 전체 프로세스가 완전하게 통합되었으며 간편해졌습니다. 데이터를 가져오는 것이 자동화되면서 잘라내기,  붙여넣기 등 수동으로 진행됐던 과정들이 생략되어 이 과정에서 발생할 수 있었던 오류를 방지합니다. 분석에서부터 데이터셋을 브라우징 하는 것 역시 통합된 워크플로우에 포함되어 있습니다. 따라서 관심있는 분자의 subset을 분석 중에 선택할 수 있으며 그에 따른 새로운 결과를 보여줍니다. 이 결과를 분석패널에서 스크리닝할 화합물로 사용할 수 있습니다.

Enumeration한 뒤, 합성을 위한 subset을 선택하기 위한 분석에 자동으로 디자인 라이브러리를 불러온 다음 합성 준비를 위해 ELN에서 자동으로 experiment를 사용합니다. 수동적인 데이터조작이 없으므로 프로세스에 오류 없이 최대의 효율을 끌어낼 수 있습니다.

icon 의사결정을 위한 실시간 데이터 접근

프로젝트 데이터를 검토하고 향후 방향에 대한 결정을 내리기 위한 정기적 프로젝트 미팅은 신약개발 과정에서 필수적입니다. 요즘도 많은 곳에서  프레젠테이션을 위한 데이터를 일일이 캡쳐해 PowerPoint를 통해 보여주고 있습니다. 이렇게 수동적으로 자료를 만들다보면 시간도 오래 걸릴뿐더라 오류도 발생하기 쉽습니다. 수동으로 데이터를 다루면서 생기는 오류를 때문에 회의에서 잘못된 데이터가 검토 될 수도 있습니다.

​오류가 있는 데이터를 바탕으로 한 잘못된 결정으로, 결국 프로젝트를 잘못된 방향으로 이끌수도 있습니다. 발표자료를 만드는 시점과 실시간의 데이터가 다를수도 있고 발표를 위한 자료에 있는 데이터를 옮기면서 오류가 발생했을 수도 있기 때문입니다.

프로젝트회의중에 Dotmatics의 시각화 솔루션을 이용하면 실시간으로 데이터를 보여주어 정확한 최신의 데이터를 볼 수 있습니다. 이를 이용하여 브레인스토밍을 하면서 실시간으로 데이터 탐색이 가능하고 시각화를 할 수 있습니다.

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