연구 데이터 자동화를 위한 Dotmatics BioBright 솔루션

실험 기기 데이터 및 CRO 데이터를 수집하고 보호하고 분석하는 자동화 솔루션

데모 요청
Overview

데이터 중심의 연구를 위한 실험 데이터 자동화 지원

대부분의 실험실에서 연구구기기에서의 데이터의 이동은 수동적으로 진행되고 있는 것이 일반적입니다. 이 때문에 데이터 이동시에 소요되는 시간 등으로 인해 효율 저하에도 영향을 끼치고 있습니다. 수동으로 데이터를 정리(data wrangling)를 하면서 오류가 생겨날 수도 있으며 이러한 오류는 AI/ML 모델링이나 의사 결정시 문제를 유발하게 될 수도 있습니다.

Dotmatics BioBright 솔루션은 완벽한 end-to-end 데이터 자동화를 가능하게 합니다.

  • 사내의 연구기기에서 생성되거나, CRO에 의해 생성된 파일을 자동으로 기록하여 안전한 클라우드 기반의 데이터 저장소에 업로드합니다.
  • 데이터 및 메타데이터를 자동화된 QA/QC 검사를 수행할 수 있습니다.
  • 데이터를 통해 대시보드 및 분석을 강화하여 운영 및 과학 통찰력을 제공할 수 있도록 합니다.
  • 머신러닝으로 데이터 분석 및 장비 모니터링을 향상합니다.
  • 개방형 API를 통해 ELN 실험 혹은 타 어플리케이션으로 데이터를 전송할 수 있습니다.

이 솔루션을 통해 연구자들은 데이터 처리업무를 감소시킬 수 있으며, 데이터 처리 업무에서 벗어나 데이터 분석 및 의사결정을 통하여 신약개발이나 신물질 개발등에 집중할 수 있습니다.

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Your challenges

Dotmatics는 가능합니다.

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기기의 파일을 쉽게 기록하고 보호

분석장비에서 파일을 수집, 네트워크에서 수동으로 파일 이동, 분석 등의 작업을 시작하기 전, 파일 저장 및 구성에 얼마나 많은 시간을 낭비하고 계신가요?

CRO로부터 파일을 안전하게 전달

이메일과 SharePoint를 통해 소중한 결과를 공유하고 계신가요?

CRO보고서를 찾아 정리하고, 매번 다른 형식의 포맷을 이해하는 시간을 소비하고 계신가요?

데이터 전송 및 동기화 혹은 결과 수령까지 기다리면서 연구가 얼마나 지연되고 있나요?

자동으로 결과 추출, QA 및 처리

다양한 기기로부터 나오는 다양한 형태의 결과물에서 데이터와 메타 데이터를 추출하는 데 얼마나 많은 소중한 시간을 보내시나요?

팀의 지속적적인 성장하고 변화로 인해 현재의 시스템을 유지할 필요가 있나요? 이로 인해 분석 파이프라인을 중단해야할 경우가 있으신가요?

파일에서 데이터/메타 데이터, 분석 및 실험 결과에 이르는 파이프라인에 발생한 오류가 프로세스 후반에서만 감지되어 오류에 빠른 대처가 불가능한가요?

기기의 아웃풋에 따라 확장 가능

대용량을 처리하는 실험실에서는 하루에 테라 바이트 단위의 파일을 생성 할 수 있습니다.

연구자와 기존 시스템이 대용량 데이터를 다루는데 문제가 없나요? 프로세스 및 스토리지 솔루션이 많은양의 파일과 데이터를 감당하지 못하나요?

데이터의 확실한 보안

파이프라인의 처음부터 끝까지 데이터가 안전하게 관리되나요? 실험기기에서 전송되는 파일과 데이터 저장소에 저장된 파일이 모두 암호화되어 있나요? 시각화 또는 분석까지 보안유지가 가능합니까?

데이터 보안 책임자가 있으신가요? 연구원들이 데이터까지 관리를 하고 계신가요? 최첨단의 데이터 보호 및 데이터 관리를 담당하는 사람이 있으신가요?

장비 동향 모니터링

Mass spectormeter에서 drift 발견 등의 장비 성능 추세를 실시간으로 확인할수 있나요?

수동 데이터 기록 및  분석이 너무 느리거나 일일이 처리해야함에 따라 사전에 관리가 불가능하여 시간이나 금전적으로 비용을 낭비하고 계시지 않나요?

project management icon

새로운 분야의 연구를 위해 빠르게 대시보드 및 분석 개발

연구원들이 새로운 방법을 개발하고 채택한 후, 이를 통해 빠르게 데이터 및 대용량 기기 데이터에 대한 새로운 관점을 제공 할 수 있나요?

Excel을 통해 수동으로 데이터를 처리하고 지속가능성이 낮은 규모에 의존하고 계신가요? 관련성 있는 데이터, 레이블이 지정된 데이터의 부족으로 인한 데이터 분석의 한계가 새로운 발전 사항들을 활용하는 데 방해가 되고 있진 않으신가요?

Decision Support Icon

정보에 기반한 결정

기기 데이터, 실험 프로토콜과 결과를 모두 한 곳에서 확인할수 있나요?

흥미롭거나 의심스러운 결과를 통해 raw데이터 및 기기 출력데이터로 드릴다운(drill down)하는것이 어려우신가요?

Capabilities

Dotmatics BioBright와 함께하세요.

icon 기기데이터 자동 기록 및 저장

  • Acquire and synchronize hundreds of terabytes of files and equipment logs
  • Upload data from instrument PCs to secure storage
  • Acquire instrument data directly from instrument software system e.g. Empower, Unicorn etc…
  • Enable CROs to transmit results and reports in real-time
  • Securely store files and data in a cloud hosted data lake
  • Search and browse the document repository

icon 자동화된 데이터 및 메타데이터 추출과 QC 결과

  • Extract metadata for over 200+ file formats, revealing hidden equipment settings, reagents used, timed steps, image metadata and more
  • Automate data QA/QC workflows.
  • Access equipment error logging and operational analytics in web dashboards

icon 애플리케이션 구축 및 통합

  • Leverage full API connectivity for both search and data delivery to informatics applications e.g. ELN, assay data management or statistical analysis/visualization packages
  • Rapidly develop lightweight cloud applications and dashboards

icon 파이프라인의 처음부터 끝까지 확실한 데이이터 보안

  • Secure end-to-end encryption for files in transit and at rest
  • Detect anomalous behavior by monitoring instrument computers and networks
  • Benefit from security developed with DARPA & verified by Sandia National Laboratories

icon 데이터나 기기 결과물 혹은 장비의 경향 시각화

  • Operational and analytic dashboards fed by real-time data and analytics
  • Scale to massive data volumes not feasible to analyze or visualize with manual methods
  • Automatically and continuosly monitor instruments allowing proactive intervention to maximize productivity and minimize the need to repeat runs

icon 대시보드와 경량 클라우드 애플리케이션을 빠르게 구축

  • Quickly build new dashboards, or lightweight cloud analytics applications to keep pace with the demands of new science and lab methods based on tools your data team is already familiar with.
  • Integrate 3rd party analytics into seamless automated workflows to derive results from the raw or parsed instrument data
  • Generate additional insights by automatically applying AI/ML analytics to the raw data

icon 한 곳에서 모든 raw 데이터와 결과를 구조화 하고 검색이 가능

  • Raw data, experiment protocols and derived results are organized as a single logical collection
  • Simple data exploration: easy to find results and then drill down to the raw data and instrument files
  • Organize data and results generated with built in or 3rd party analytics
  • The BioBright solution can automatically compile data packages using business rules, experiment metadata and workflow presets

Outcomes

고객 우수 사례

icon Mass Spec Core Facility

A Mass-Spec core facility at a large pharma company implemented the BioBright solution to capture and process the 700Gb – 1Tb of files they were producing per week. They replaced a process that required scientists to manually load their data into a data store and then manually analyse it – taking each scientist 2-3 days per week

With the Biobright solution

  • Data collection was sped up by 63x times
  • Each scientist saved two-thirds of their time formerly spent on manual processing
  • Data was automatically QC’d and dashboards ready for review within seconds of the analysis completing
  • Operational analysis and dashboards allowed instrument drift to be detected and scientists to develop novel system suitability metrics for high value samples

icon High Content Screening Lab

A high content screening lab at a leading biotech had a legacy HCS data processing infrastructure that was slow, lossy and manual

  • Slow, as it relied on time consuming, periodic scripted uploads of raw results files to an enterprise file management system, and from there to image analysis software
  • Lossy, because users could only transfer final results and native instrument software was struggling to keep up with data volume, crashing often and leading to data loss
  • Manual, as management of the image analysis server required manual data purging and manual transfer of aging data

The legacy infrastructure was replaced with the fast, lossless and insightful Dotmatics BioBright solution

  • Fast, as data transfer from the instruments to the BioBright cloud and to/from the image analysis software is full automated and happens in real-time
  • Lossless, because the raw data, protocols AND the full results are captured as a single collection in the BioBright cloud repository as soon as they’re created. If the run crashes part way, the BioBright platform has already synced the partial data
  • Insightful, as real-time dashboards enable equipment monitoring and decision making

icon BioReactor Scale-up Facility

A large pharma’s bioreactor scale up facility used manual collection methods to gather data from their reactors. researchers used Excel to aggregate data across the various sizes of reactor to make decisions about reactor set-up during the scale up process. It took 2 to 3 days to gather up all the data, analyze it and make decisions.

The aggregated data became available fast enough to allow previously impossible analytics. For example, an AI model of dissolved oxygen (DO) crashes was applied to the readily available data, and predicted the likelihood of a crash up to two hours in advance. This gives the operator time to adjust the bioreactor to mitigate the potential problem.

Products

솔루션 구현을 위한 제품 리스트

iconDarwin Sync

  • Darwin Sync client installs on PCs connected to instruments, in the cloud or at CROs
  • Encrypts files and securely uploads to the cloud
  • Direct API connections for instrument software platforms (e.g. Empower, Unicorn etc)
  • Stores files in a secure data lake on the cloud
  • Search and browse for files

iconBioBright Cloud

  • Parse and extract data and metadata from file and non-file based systems
  • Define and apply QA/QC workflows to the data
  • Build lightweight dashboards and visualization apps for operational insights
  • Rapidly integrate data into other applications via BioBright’s API-first approach (e.g. ELN, image analysis, assay data management, …)

iconDotmatics Studies Notebook

Dotmatics Studies Notebook is an Electronic Laboratory Notebook (ELN) with flexible templating to capture, store and search experiments from all scientific disciplines.

  • Flexible protocols (implemented as templates) allow the single ELN to accommodate highly structured experiments such as synthetic chemistry and protein purifications, as well as more ad hoc experiment types often useful for target identification and discovery biology experiments. Ad hoc experiments are also often used to support a transition from paper based notebooks
  • Dotmatics Studies Notebook allows for collaboration on experiments by multiple scientists within or between organizations

iconDotmatics Studies

Dotmatics Studies is a highly flexible, innovative screening data management solution to capture and analyze all types of screening experiments from high content (HCS) and high throughput (HTS) to dose-response and DMPK studies.

  • Defines analysis protocols for plate and non-plate based assays
  • Provides out-of-the-box and custom assay protocols, curve fit calculations, plate readers, and plate layouts captured and stored for re-use
  • Supports very high data volume assays
  • Defines business rules for very automated classification of results
  • Manual or automated processing allows screening scientists to apply the screening protocols to process raw instrument and validate the results, or experiment creation and processing to be driven via an automation layer.
  • Once completed and validated, screening results are immediately available via Browser to the project team