생물학적제제의 개발

Multi-Model 신약개발 지원

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OVERVIEW

화학과 생물 그리고 정보학

생명과학 기업은 다양한 천연유래의 생물학적 제제나 화학적 변형 생물학적 제제의 개발에 투자를 늘리고 있습니다. 그러나 많은 기업에서는 파일을 공유하거나 및 스프레드시트에 데이터를 가져오는 프로세스를 많이 사용 중이며, 이는 프로세스, 실험, 엔티티, 대량의 데이터를 추적하는데 어려움이 있을 수 박에 없습니다. 생물학적 제제 개발을 위한 Dotmatics의 정보학 솔루션은 이러한 문제를 해결하여 성공적이고 효율적이며 혁신적으로 프로젝트를 진행할 수 있도록 지원합니다.

다양한 분야 및 조직이나 팀 내부에서 모든 생물학적 데이터를 기록하고, 프로세스를 추적한 다음 분석 및 의사결정 지원 기능을 이용하여 프로젝트를 위한 최적의 의사결정을 할 수 있습니다.

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CHALLENGES

Dotmatics는 가능합니다.

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공동 연구

생물학적 제제 개발 프로젝트는 부서, 분야, 물리적 위치를 넘나드는 프로젝트입니다. 프로젝트를 효율적으로 수행하기 위해서는 업무요청 및 데이터와 결과가 모든 유관부서 구성원들에게 원활하게 전달되어야 합니다.

최적의 의사결정

프로젝트팀의 모든 구성원은 데이터가 저장된 장소에 관계없이 관련된 모든 프로젝트 데이터에 실시간으로 접근할 수 있어야하며 프로젝트 진행에 대한 최적의 의사결정을 내릴 수 있어야합니다.

효율적 실험실 워크플로우

연구 효율성의 증가는 연구 개발주기를 단축시킵니다. 기기에서 부터 만들어진 데이터 기록의 자동화와 팀 구성원들의 다양한 워크플로우를 가지고 원활한 통합 데이터 워크플로우를 구성할 수 있습니다.

CAPABILITIES

Dotmatics와 함께하세요.

icon 다양한 분야의 워크플로우

생물학적 제제의 개발 워크플로우는 복잡하고 반복성이 높아 기업 내 서로 다른 팀 간, 또는 협업 조직 간에 많은 업무 전달이 필요합니다.

Dotmatics 솔루션은 모든 생물학적 제제 개발의 워크플로우를 제공할 수 있으며 생물학에 특화된 전자 실험 노트(BioELN), 생물 유래 데이터 등록, 샘플 관리, 어세이 데이터 관리, 작업의뢰 시스템, 검색, 시각화, 데이터 분석 어플리케이션 등이 있습니다.

Dotmatics 솔루션은 각 워크플로우를 원활하게 연결하여 하나의 통합 워크플로우로 사용할 수 있습니다. 예를 들어, BioELN의 인터페이스에서 간단하게 새로운 엔티티를 등록 시스템에 생성할 수 있습니다. 관리자는 팀간 워크플로우를 생성하고 모니터링하는 작업 의뢰 시스템으로 사용할 수도 있습니다. 대시보드에서는 모든 팀원의 프로젝트의 상태와 워크플로우를 모니터링 할 수 있습니다.

icon 분자생물학자를 위한 정보학 워크플로우

분자생물학자는 생물학에 특화된 전자실험노트인 BioELN에서 실험을 기록하여 그 데이터를 직접 Bioregister에게 전송할 수 있습니다. Bioregister는 DNA, RNA, 단백질, 항체, 항체약물복합체, 플라스미드, 화학적 변형 펩타이드, 뉴클레오티드, 세포주, 사용자 정의 엔티티 등 모든 유형의 과학 데이터를 기록할 수 있는 시스템입니다. Bioregister는 엔티티와 그 속성뿐 아니라 엔티티 간의 관계성도 기록합니다. 사용자는 샘플, 클론, 벡터, 정제, 발현 정보를 기록하여 단백질 생산관련 정보도 관리할 수 있습니다. 샘플을 이용할 수 있게 되면 Cascade를 사용하여 어세이 서비스를 요청할 수 있습니다. Bioregister에 저장된 엔티티는 BioELN에서 직접 액세스 할 수 있습니다.

icon 샘플관리자를 위한 워크플로우

샘플 관리자는 Inventory를 사용하여 샘플들이 저장위치에 어떻게 보관되는지 쉽게 확인이 가능하며 샘플의 수명주기를 관리하고 테스트용 앨리퀏(분주 샘플)이나 플레이트를 분출 정보를  관리할 수 있습니다. Dotmatics 플랫폼 내 RESTful Web 서비스를 통해 BioELN에서 Inventory의 많은 기능들을 직접 만나보실 수 있습니다. 사용자 인터페이스를 변경하지 않고 워크플로우를 간소화할 수 있습니다.

icon 분석 담당자를 위한 워크플로우

분석 담당자는 Studies를 사용하여 1차, 2차 및 DMPK 분석에서 데이터를 가져오고 분석할 수 있습니다. Vortex에서는 분석데이터의 시각화 및 통계적 분석도 가능합니다.

검증된 분석 결과는 연구팀에 직접 공개할 수 있습니다.

Cascade를 사용하여 샘플이나 플레이트를 요청할 수 있습니다.

Studies는 Bio ELN과 동일한 프레임워크를 사용합니다.

icon 의사결정지원

BioELN에 실험이 기록되어 실험결과를 확인할 수 있게 되면 실험, 서열, 생물학적 엔티티, 샘플, 분석을 포함한 모든 연구 데이터를 Browser로 검색할 수 있습니다.

Vortex는 그래픽 인터페이스로 스크립트를 쓸 필요는 없이 생물정보학 분석을 가능하게 합니다. 시퀀스 alignment나 clustering, 서열과 활성도 간의 관계를 평가하고 예측 모델을 구축화 하는 방법, 통계 분석 및 데이터의 시각화 등이 가능합니다. 이러한 기능을 통해 데이터에 입각한 적절하고 신속한 의사결정을 할 수 있습니다.

실시간으로 반영되는 대시보드는 프로젝트 관리 의사 결정을 지원합니다.

icon 공동 연구에 최적

Dotmatics의 소프트웨어는 제약, 생명공학, CRO 및 학술연구 등 공동연구 네트워크 협업을 위해 설계되었습니다. 실험 및 연구 데이터를 실시간으로 공유할 수 있으며 이벤트 피드나 대시보드에는  최신 상태로 실시간 업데이트됩니다. 또, 협업 및 커뮤니케이션 툴을 사용해 효율적인 공동 연구를  지원합니다.

Products

솔루션 구현을 위한 제품 리스트

iconDotmatics Browser

Dotmatics Browser는 강력한 웹기반 검색 및 리포팅 솔루션으로 Dotmatics 및 타사의 연구 데이터베이스에서 통합 검색을 제공하여 연구원들이 필요할 때 언제든 데이터 저장 위치에 상관없이 모든 데이터에 접근할 수 있습니다.

Browser로 무엇을 할 수 있나요?

  • 화학, 생물, 어세이, 연구노트 및 기타 연구 데이터베이스를 통합하여 단일 화면에 통합 검색 및 탐색 기능을 제공합니다.
  • 화학 구조의 하부 구조 및 유사성 같은 과학적 검색을 제공합니다.
  • 프로젝트 수준 및 개인에 따른 검색 양식 및 보기, 검색 내역, 목록 및 보고서를 관리합니다.
  • 양식, 표 및 차트로 강력한 데이터 시각화를 구현합니다.

iconDotmatics Vortex

Dotmatics Vortex는 과학적 의사결정을 지원하기 위한 대화형 데이터 시각화 및 분석 솔루션입니다. 스프레드시트 패러다임을 구축하고 확장하여 데이터의 복잡성과 크기를 탐색하고 이해하는데 필요한 데이터 조작, 통계 분석 및 정교한 그래프 기능을 제공합니다. Vortex는 과학적으로 화학 정보학과 생물 정보학 분석 및 시각화 기능을 제공하고 있습니다.

 

  • 사용자가 크고 복잡한 데이터를 이해하고 수정및 선택할 수 있습니다.
  • 팀은 공유 가능한 workspace와 재사용 가능한 템플릿을 통해 과학적 분석에 대한 협업이 가능합니다.
  • 숫자, 텍스트, 이미지, 화학 구조 및 생물학적 서열 데이터를 이해할 수 있습니다.
  • 차트 및 테이블을 포함한 고성능의 대화형 데이터 시각화를 생성합니다.
  • 수천 개의 데이터 설명 혹은 전체 유전체 서열을 포함한 세포로 된 수 백만개의 화합물 테이블 같은 매우 큰 데이터 세트를 처리합니다.
  • 데이터 마이닝, 통계, 화학 정보학 및 생물 정보학 분석 기능이 내장되어 있습니다.
  • 여러 유형의 파일 또는 Browser 검색 데이터를 불러오거나 데이터베이스 직접 데이터를 불러올 수 있습니다.

iconBioregister

Dotmatics’ Bioregister는 시퀀스 기반 및 화학적 변형 생물물질이나 구조가 없는 생물학적 엔티티 등록을 위한 웹 기반 응용 프로그램으로, 생물물질 신약개발 기관이 연구 엔티티 고유성을 보장하고 지적 재산을 보호 할 수 있습니다. Bioregister는 DNA, RNA, 펩타이드 및 단백질, 항체, conjugate, non-natural 펩타이드 및 뉴클레오티드, 플라스미드, 세포주 및 사용자가 정의 엔티티를 포함한 광범위한 생물 제제 엔티티들을 관리합니다. 또한, 사용자는 정제 및 발현 정보, 기타 단백질 생산 데이터의 배치(batch) 및 샘플을 기록 할 수 있습니다.

  • 화학적으로 변형된 서열 및 서열이 없는 물질, 관련 속성 데이터 및 계보를 포함한 생물학적 물질을 기록하고 관리합니다.​
  • 자연 및 비자연 엔티티의 화학적 표현 (가능한 경우)을 생성합니다.​
  • 엔티티의 고유성을 결정하고 등록 번호를 할당합니다.​
  • 단백질 발현, 정제 및 특성화와 같은 엔티티 생성과 관련된 데이터를 관리합니다.​
  • 완전한 관계 추적을 통해 엔티티에 대해 생성된 단백질의 배치(batch) 및 샘플을 기록합니다.

iconDotmatics Studies Notebook

Dotmatics Studies Notebook (ELN)은 모든 과학 분야의 실험 데이터 수집, 저장 및 검색 할 수 있는 유연한 템플릿 기반 전자 연구 노트 (ELN)입니다.

 

  • 템플릿으로 구현되는 유연한 프로토콜을 통해  합성 화학 및 단백질 정제와 같은 고도로 구조화 된 실험 뿐만 아니라 생물학 실험을 통한 표적 식별 및 개발에서 유용한 ad-hoc 형태의 실험을 수용합니다. Ad-hoc은 종이 기반 연구노트에서 전자연구노트로 전환시에 종종 사용됩니다.​
  • Dotmatics Studies Notebook을 사용하면 조직 내 혹은 조직의 여러 연구원이 공동 연구를 수행 할 수 있습니다.​

iconDotmatics Studies

Dotmatics Studies 는 매우 유연하고 혁신적인 스크리닝 데이터 관리 솔루션으로, HCS 및 HTS에서 용량 반응 (dose-response) 및 DMPK 연구에 이르기까지 모든 유형의 스크리닝 실험을 저장하고 분석합니다.

  • Plate 및 non-plate 기반 어세이에 대한 분석 프로토콜을 정의​
  • 즉시 사용 가능하(OOTB)거나 사용자 맞춤의 어세이 프로토콜, Curve fit 계산, Plate reader 및 기록 및 저장시 재사용 할 수 있는 plate 레이아웃을 제공​
  • 많은 양의 데이터 어세이도 지원합니다.​
  • 결과 분류의 자동화를 위한 비즈니스 규칙을 정의​
  • 수동 또는 자동 처리를 통해 스크리닝 분석하는 연구원은 스크리닝 프로토콜을 적용하여 기기의 raw 데이터를 처리하고 결과를 검증하거나 실험 생성 및 처리를 자동화 레이어를 통해 구동
  • 분석을 완료되고 검증이 끝나면, 검색 결과는 Browser를 통해 프로젝트 팀에게 즉시 제공됩니다.​

iconDotmatics Inventory

Dotmatics Inventory is a fully searchable sample and materials inventory that tracks chemicals, biologics, instruments and associated data across a hierarchy of locations and manages the dispensing and plating workflows, as samples are moved through an R&D process.

  • Defines a hierarchy of storage locations for an organization
  • Track samples in containers such as bottles and plates in those storage locations
  • Manages research materials, reagents and assets
  • Manages the aliquoting and dispensing workflows to distribute samples for testing
  • Maintains a full audit trail
  • Allows for searching and reporting on inventory information alongside other corporate data

iconDotmatics Platform

The Dotmatics Platform is the common framework that supports the Dotmatics web-based scientific applications and allows them to work together to provide users seamless end-to-end workflows. The Platform supports managed deployments in the Cloud or self-supported deployments on premise. An open architecture enables workflows to include third-party software integration. When used together with Dotmatics Browser the Platform allows federated data access across corporate and external research data.The Dotmatics Platform is completely unified – it provides common data models, code and architecture to support business workflows that span the capabilities of the individual applications. This is important for enterprise enablement of research organizations, providing ease of maintenance and development. It gives the lowest possible total cost of ownership compared to platforms that support their applications with less tightly integrated collections of multiple technologies and/or architectures with multiple development histories.

  • Provides the framework that supports all Dotmatics web-based scientific applications and allows them to work together to provide seamless workflows.
  • Portal for administrators to manage users and groups, applications and configurations
  • Provides APIs for automation and integration with 3rd party software
  • When used in conjunction with Dotmatics Browser provide access to data from across an organization and externally