생명과학 연구

실험 효율 최대화 및 정보 기반의 의사결정

OVERVIEW

효율성 향상 및 혁신을 지원

생명과학의 연구는 다양한 분야가 포함되어 있고 데이터 주도적이며 끊임없이 진화하는 특성을 가지고 있습니다. 정보학 솔루션 역시 업계와 발맞춰 다음과 같이 발전해 나아가야 합니다.

  • 새로운 치료제 개발을 위한 워크플로우를 지원하고 다양해지는 치료제의 종류에 대응할 수 있어야 합니다.
  • 특정 연구실 내에서 진행되는 연구이든 공동으로 진행되는 연구로 연구이든 효율을 최대화할 수 있어야 합니다.
  • 연구 데이터의 양과 다양성, 실험실의 자동화에 대응할 수 있어야 합니다.
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CHALLENGES

Dotmatics는 가능합니다.

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다양한 연구에 대응

저분자 약물에서부터 화학적 변형 생물학적 제제, 세포치료, 유전자 치료제에 이르기까지 생명과학 연구는 다양화되고 있습니다. 이러한 엔티티 및 방대한 데이터는 실험실 정보 시스템에 기록되어야 하며 시스템에서 데이터를 검색하고 분석할 수 있어야 합니다.

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공동 연구

생물학적 제제 개발 프로젝트는 부서, 분야, 물리적 위치를 넘나드는 프로젝트입니다. 프로젝트를 효율적으로 수행하기 위해서는 업무요청 및 데이터와 결과가 모든 유관부서 구성원들에게 원활하게 전달되어야 합니다.

최적의 의사결정

프로젝트팀의 모든 구성원은 데이터가 저장된 장소에 관계없이 관련된 모든 프로젝트 데이터에 실시간으로 접근할 수 있어야하며 데이터를 기반으로 프로젝트 진행에 관한 최적의 의사결정을 내릴 수 있어야합니다.

효율적 실험실 워크플로우

다음과 같은 특징으로 연구 효율성의 증가는 연구 개발주기를 단축시킵니다. 첫째, 실험실의 워크플로우를 반영하는 원활한 통합 데이터 워크플로우를 구성할 수 있습니다. 둘째, 기기에서 부터 만들어진 데이터를 자동으로 기록합니다. 셋째, 팀 구성원들의 다양한 기능의 워크플로를 활용할 수 있습니다.
CAPABILITIES

Dotmatics와 함께하세요.

icon 다양한 분야의 워크플로우

생명과학 연구 워크플로우는 복잡하고 반복성이 높아 기업 내 서로 다른 팀 간, 또는 협업 조직 간에 많은 업무 전달이 필요합니다.

Dotmatics솔루션은 치료제의 형태와 무관하게 생명과학 워크플로우의 모든 단계에 대응하는 포괄적인 솔루션을 제공합니다. 실험, 엔티티, 샘플과 분석결과를 기록을 위한 기능을 하나의 플랫폼에 구축할 수 있습니다.이 플랫폼은 각 워크플로우를 심플한 인터페이스로 원활하게 연결됩니다. 예를 들어 의약 화학자나 분자생물학자는 ELN(전자실험노트) 화면에서 실험프로토콜을 기록할 수 있으며 엔티티 정보를 등록하고 샘플 재고 관리도 가능합니다.마찬가지로 분석 워크플로우도 심플합니다. 과학자는 모든 관련 데이터를 수집하여 하나의 애플리케이션 내에서 데이터를 시각화하고 분석할 수 있습니다. 다른 사람이나 다른 공동연구를 진행할 때도 작업의뢰를 할 수 있으며 진행상황도 확인할 수 있습니다.

항체개발을 위한 워크플로우

저분자 약물개발을 위한 워크플로우

icon 다양한 연구 기록

Dotmatics 솔루션은 저분자, 생물학적 제제, 화학적 변형 생물학적 제제, 접합체(conjugates), 세포치료 등 다양한 분야의 연구를 지원합니다. 또한, 텍스트나 수치뿐 아니라, 분자 구조나 생물의 서열(sequence)을 이해할 수 있기에, 새롭고 다양한 형태의 화학적 변형 생물학적 제제의 개발 등 새로운 치료제의 개발에도 신속히 대응할 수 있습니다.

화학적 변형 약물개발을 위한 Dotamtics 솔루션에 관해 알아보세요.

icon 실험, 엔티티, 샘플, 분석 데이터를 기록

Dotmatics솔루션은 실험실 워크플로우 전체를 디지털로 기록합니다. 전자실험노트(ELN)에서는 의약 화학, 분자생물학, 분석과학 등의 폭넓은 실험 기록을 할 수 있으며 등록 시스템에서는 생물학적 제제, 화학적 변형 생물학적 제제, 접합체(conjugates), 저분자 또는 세포주와 같은 구조식을 가지지 않는 엔티티를 등록할 수 있습니다. 또한 상위항목으로부터 생성된 계통을 추적하여 엔티티간의 관계를 추적할 수도 있습니다.

샘플 관리 시스템에서는 샘플의 장소와 양을 기록해 분석데이터 관리 시스템으로 보낼수 있으며 분석데이터 관리시스템에서는 분석 후 결과를 기록합니다. 대량, 고함량, 용량-반응 데이터, Kinetic, DMPK 실험 모두 지원가능합니다. 모든 데이터는 공통 플랫폼에 저장되므로 기록되는 즉시 데이터에 접근할 수 있습니다.

icon 실험실 데이터 수집 및 분석 자동화

Dotmatics솔루션은 실험기기에서 자동으로 데이터를 Dotmatics의 실험실 데이터 자동화 플랫폼은 실험실의 효율성을 크게 높일 수 있습니다. 실험 기기에서 데이터를 수집하여 데이터 레이크에 안전하게 저장할 수 있습니다. 또한, 수집한 데이터를 해석하고 메타데이터를 분석하고 유효성 검사를 수행할 수 있습니다. 분석결과는 전자연구노트나 분석데이터관리 시스템으로 직접 보낼 수 있습니다. 이 모든 과정이 사람의 개입이 없이 자동화로 진행되기에 데이터 수집 및 처리에 작업에 소요하는 시간을 절약해줍니다. 또한, 무결한 데이터를 활용하여 AI나 ML 에 사용될 수 있으며 데이터에 입각한 의사결정에 신빙성을 더해줍니다.

Dotmatics의 실험실 데이터 자동화 솔루션에 관해 알아보세요.

icon 데이터 지능(Data intelligence)기반 의사결정

Dotmatics의 솔루션은 모든 데이터베이스를 통합하여 검색이 가능하기 때문에 데이터의 사일로화를 해소할 수 있으며 데이터를 Dotmatics 시스템이나 다른 in-house 소프트웨어 혹은 외부 데이터베이스에 보관 할 수 있습니다. 이렇게 저장된 데이터는 한 화면에서 구조와 시퀀스를 이용한 검색이 가능합니다. 또한, Dotmatics의 그래픽 분석 도구를 이용하여 쉽게 분석을 할 수 있으며 시각화도 가능합니다. 이를 통해 충분한 정보를 바탕으로 신속하게 의사를 결정 할 수 있습니다.

Dotmatics의 데이터 지능(Data intelligence)에 관해 알아보세요.

Dotmatics의 화학물 설계 관련 솔루션에 관해 알아보세요.

icon 공동 연구에 최적

Dotmatics의 소프트웨어는 제약, 생명공학, CRO 및 학술연구 등 공동연구 네트워크 협업을 위해 설계되었습니다. 실험 및 연구 데이터를 실시간으로 공유할 수 있으며 이벤트 피드나 대시보드에는  최신 상태로 실시간 업데이트됩니다. 또, 협업 및 커뮤니케이션 툴을 사용해 작업 요청 및 실험과 실험결과를 공유하는 팀들 간의 효율적인 공동 연구를  지원합니다.

공동 네트워크 연구를 위한 Dotmatics 솔루션에 관해 알아보세요.

CASE STUDY

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Products

솔루션 구현을 위한 제품 리스트

iconDotmatics Browser

Dotmatics Browser는 강력한 웹기반 검색 및 리포팅 솔루션으로 Dotmatics 및 타사의 연구 데이터베이스에서 통합 검색을 제공하여 연구원들이 필요할 때 언제든 데이터 저장 위치에 상관없이 모든 데이터에 접근할 수 있습니다.

Browser로 무엇을 할 수 있나요?

  • 화학, 생물, 어세이, 연구노트 및 기타 연구 데이터베이스를 통합하여 단일 화면에 통합 검색 및 탐색 기능을 제공합니다.
  • 화학 구조의 하부 구조 및 유사성 같은 과학적 검색을 제공합니다.
  • 프로젝트 수준 및 개인에 따른 검색 양식 및 보기, 검색 내역, 목록 및 보고서를 관리합니다.
  • 양식, 표 및 차트로 강력한 데이터 시각화를 구현합니다.

iconDotmatics Studies Notebook

Dotmatics Studies Notebook (ELN)은 모든 과학 분야의 실험 데이터 수집, 저장 및 검색 할 수 있는 유연한 템플릿 기반 전자 연구 노트 (ELN)입니다.

Studies Notebook으로 무엇을 할 수 있나요?

  • 연구원들은 Dotmatics Studies Notebook을 사용하여 모든 팀원이 쉽게 검색 할 수 있는 형태로 실험 데이터를 수집하고 저장할 수 있습니다. 또한, Dotmatics Studies Notebook 을 통해 지적재산권 보호 및 감사 오딧을 하고 서명 절차를 정의 할 수 있습니다.​
  • 템플릿으로 구현되는 유연한 프로토콜을 통해 합성 화학 및 단백질 정제와 같은 고도로 구조화 된 실험 뿐만 아니라 생물학 실험을 통한 표적 식별 및 개발에서 유용한 ad-hoc 형태의 실험을 수용합니다. Ad-hoc은 종이 기반 연구노트에서 전자연구노트로 전환시에 종종 사용됩니다.​
  • Dotmatics Studies Notebook을 사용하면 조직 내 혹은 조직의 여러 연구원이 공동 연구를 수행 할 수 있습니다.​

iconDotmatics Bioregister

Dotmatics의 Bioregister는 시퀀스 기반 및 화학적 변형 생물물질이나 구조가 없는 생물학적 엔티티 등록을 위한 웹 기반 응용 프로그램으로, 생물물질 신약개발 기관이 연구 엔티티 고유성을 보장하고 지적 재산을 보호 할 수 있습니다. Bioregister는 DNA, RNA, 펩타이드 및 단백질, 항체, conjugate, non-natural 펩타이드 및 뉴클레오티드, 플라스미드, 세포주 및 사용자가 정의 엔티티를 포함한 광범위한 생물 제제 엔티티들을 관리합니다. ​또한, 사용자는 정제 및 발현 정보,  기타 단백질 생산 데이터의 배치(batch) 및 샘플을 기록 할 수 있습니다.

Bioregister로 무엇을 할 수 있나요?

  • 화학적으로 변형된 서열 및 서열이 없는 물질, 관련 속성 데이터 및 계보를 포함한 생물학적 물질을 기록하고 관리합니다.​
  • 자연 및 비자연 엔티티의 화학적 표현 (가능한 경우)을 생성합니다.​
  • 엔티티의 고유성을 결정하고 등록 번호를 할당합니다.​
  • 단백질 발현, 정제 및 특성화와 같은 엔티티 생성과 관련된 데이터를 관리합니다.​
  • 완전한 관계 추적을 통해 엔티티에 대해 생성된 단백질의 배치(batch) 및 샘플을 기록합니다.

iconDotmatics Register

Dotmatics Register는 기업의 화학 물질 등록 및 시약 데이터베이스를 관리하고 유지하는데 사용하는 웹 기반 화합물 및 배치(batch) 등록 시스템 입니다.

​Register로 무엇을 할 수 있나요?

  • 새로 합성 또는 구입한 화합물에 대한 화학 구조 및 관련 데이터 등록​
  • 회사 ID 및 새로운 배치나 새로운 Lot ID를 생성하여 할당하고 고유성을 결정​
  • 단일 화합물 또는 배치 등록 가능​
  • 자체 사용자 인터페이스나 Dotmatics 또는 타사 전자연구노트에서 등록 가능

iconDotmatics Studies

Dotmatics Studies는 매우 유연하고 혁신적인 스크리닝 데이터 관리 솔루션으로, HCS 및 HTS에서 용량 반응 (dose-response) 및 DMPK 연구에 이르기까지 모든 유형의 스크리닝 실험을 저장하고 분석합니다.

Studies로 무엇을 할 수 있나요?

  • Plate 및 non-plate 기반 어세이에 대한 분석 프로토콜을 정의​
  • 즉시 사용 가능하(OOTB)거나 사용자 맞춤의 어세이 프로토콜, Curve fit 계산, Plate reader 및 기록 및 저장시 재사용 할 수 있는 plate 레이아웃을 제공​
  • 많은 양의 데이터 어세이도 지원합니다.​
  • 결과 분류의 자동화를 위한 비즈니스 규칙을 정의​
  • 수동 또는 자동 처리를 통해 스크리닝 분석하는 연구원은 스크리닝 프로토콜을 적용하여 기기의 raw 데이터를 처리하고 결과를 검증하거나 실험 생성 및 처리를 자동화 레이어를 통해 구동
  • 분석을 완료되고 검증이 끝나면, 검색 결과는 Browser를 통해 프로젝트 팀에게 즉시 제공됩니다.​

iconDotmatics Vortex

Vortex는 과학적 의사결정을 지원하기 위한 대화형 데이터 시각화 및 분석 솔루션입니다. 스프레드시트 패러다임을 구축하고 확장하여 데이터의 복잡성과 크기를 탐색하고 이해하는데 필요한 데이터 조작, 통계 분석 및 정교한 그래프 기능을 제공합니다.​ Vortex는 과학적으로 화학 정보학과 생물 정보학 분석 및 시각화 기능을 제공하고 있습니다.​

Dotmatics Vortex로 무엇을 할 수 있나요?

  • 사용자가 크고 복잡한 데이터를 이해하고 수정및 선택할 수 있음.​
  • 팀은 공유 가능한 workspace와 재사용 가능한 템플릿을 통해 과학적 분석에 대한 협업이 가능
  • 숫자, 텍스트, 이미지, 화학 구조 및 생물학적 서열 데이터를 이해
  • 차트 및 테이블을 포함한 고성능의 대화형 데이터 시각화를 생성
  • 수천 개의 데이터 설명 혹은 전체 유전체 서열을 포함한 세포로 된 수 백만개의 화합물 테이블 같은 매우 큰 데이터 세트를 처리
  • 데이터 마이닝, 통계, 화학 정보학 및 생물 정보학 분석 기능이 내장
  • 여러 유형의 파일 또는 Browser 검색 데이터를 불러오거나 데이터베이스 직접 데이터를 불러올 수 있음.

iconDotmatics Blueprint

Blueprint는 웹 기반의 시각화 및 과학 분석 어플리케이션입니다. 이는 small molecule 프로젝트에 참여하는 연구원들의 데이터 시각화 및 분석과 화합물 연구를 지원하여 다음에 만들 화합물을 설계하는 데 도움을 줄 수 있도록 만들었습니다.

Blueprint로 무엇을 할 수 있나요?

  • 데이터 분석 비전문가인 실무연구원들이 데이터분석툴에 하루종일 얽매이지 않도록 간단한 가이드를 제공하는 웹 유저인터페이스
  • 분자데이터셋을 탐색하도록 과학데이터를 차트나 테이블 및 그리드를 사용하여 시각화
  • SAR 데이터셋을 이해하기 위한 큐레이션된 화학계산 및 화학정보학 분석 워크플로우 내장
  • Workspace 공유를 통한 커뮤니케이션 가능
  • Dotmatics 제품군과 완벽한 통합
    • Browser : 프로젝트 데이터 수집
    • Reaction Workflow : 라이브러리와 화합물들 디자인
    • Vortex : 심층적 ad-hoc 분석

iconDotmatics Platform

The Dotmatics Platform is the common framework that supports the Dotmatics web-based scientific applications and allows them to work together to provide users seamless end-to-end workflows. The Platform supports managed deployments in the Cloud or self-supported deployments on premise. An open architecture enables workflows to include third-party software integration. When used together with Dotmatics Browser the Platform allows federated data access across corporate and external research data.The Dotmatics Platform is completely unified – it provides common data models, code and architecture to support business workflows that span the capabilities of the individual applications. This is important for enterprise enablement of research organizations, providing ease of maintenance and development. It gives the lowest possible total cost of ownership compared to platforms that support their applications with less tightly integrated collections of multiple technologies and/or architectures with multiple development histories.

  • Provides the framework that supports all Dotmatics web-based scientific applications and allows them to work together to provide seamless workflows.
  • Portal for administrators to manage users and groups, applications and configurations
  • Provides APIs for automation and integration with 3rd party software
  • When used in conjunction with Dotmatics Browser provide access to data from across an organization and externally

iconDotmatics Chemselector

Dotmatics Chemselector manages very large chemistry datasets with fast search and trivially simple maintenance/update. It has a modern user interface focused on browsing and filtering for molecule, reagent and sample selection. The available eMolecules+ for Chemselector dataset provides access to highly curated eMolecules sourcing data.

Chemselector

  • High performance chemical searching, filtering and selection designed to support critical medicinal and synthetic chemistry workflows including:
    • building block selection
    • fragment set design
    • screening molecule selection for scaffold hopping
    • chemical series validation for hit to lead campaigns (“SAR by catalog”)
  • Uses Dotmatics provided datasets such as eMolecules+ for Chemselector and ChEMBL for Chemselector, or datasets built in-house from corporate or public databases

eMolecules+ for Chemselector

  • A sourcing dataset of over 20 million compounds and 8 million unique chemical substances with availability, pricing and packaging information from hundreds of suppliers using data curated by eMolecules
  • Provides additional information to the eMolecules source data to enhance searching, including deprotected structures, calculated physicochemical properties and structure classes
  • Simple monthly updates provide the latest eMolecules supplier and catalog data

iconDotmatics Cascade

Dotmatics Cascade manages the requesting and assignment of laboratory tasks, and tracking the progression of samples, across multiple teams within an organization or across a collaborating network.

  • Dotmatics Cascade allows organizations to define available services, such as assay execution or analysis and the associated scientific team
  • Scientists create requests for services and submit compounds Service managers manage, group and assign requests for execution
  • Service team scientists accept requests, create and auto populate experiments to execute them
  • Teams can see request status and monitor compound or sample progression

iconDotmatics Reaction Workflows

Dotmatics Reaction Workflows is a graphical environment that enables scientists to build and execute data processing workflows to perform common cheminformatics tasks, such as library enumeration, structure normalization and compound profiling. Users build workflows in a drag-and-drop environment by selecting and connecting nodes that provide inputs (e.g a list of reagents) and outputs (e.g. view in Dotmatics Vortex) or perform actions (e.g. perform a reaction), configuring them with data and then executing the workflow to produce results. Many different tasks can be configured including:

  • Synthetic library enumeration for an ELN experiment
  • Virtual library enumeration and profiling for virtual screening
  • Structure normalization for registration
  • Idea generation via lead hopping or to avoid liabilities
  • Chemistry file clean up

iconDotmatics Inventory

Dotmatics Inventory is a fully searchable sample and materials inventory that tracks chemicals, biologics, instruments and associated data across a hierarchy of locations and manages the dispensing and plating workflows, as samples are moved through an R&D process.

  • Defines a hierarchy of storage locations for an organization
  • Track samples in containers such as bottles and plates in those storage locations
  • Manages research materials, reagents and assets
  • Manages the aliquoting and dispensing workflows to distribute samples for testing
  • Maintains a full audit trail
  • Allows for searching and reporting on inventory information alongside other corporate data

iconDotmatics Pinpoint

Dotmatics Pinpoint is a chemical cartridge for indexing and searching chemistry within Oracle databases.

Pinpoint enables indexing of chemical structures, calculations of physical chemical properties and substructure searches within an Oracle database. It is used to support structure searching with Dotmatics Browser, check for structural uniqueness and register molecules in Dotmatics Register, and store and search chemical reactions in Dotmatics Studies Notebook.

iconDotmatics Elemental

Dotmatics Elemental is a chemical sketcher that enable scientists to draw, edit and save structures and reactions, and calculate properties.

  • Sketch molecules, reactions and structure queries
  • Calculate chemical properties
  • Available as a fully-featured desktop application, iOS app or lightweight JavaScript plugin for sketching in-line in webpages