데이터지능 (Data Intelligence)

데이터 중심의 연구개발을 현실로

OVERVIEW

데이터 기반의 R&D 실현

연구개발팀에서는 예산이 축소되는 상황에 있어서도 개발을 가속화의 압박 때문에 데이터 중심 연구개발 모델의 수요가 높아지고 있습니다. 조직에서 기존  연구데이터의 재사용을 목적으로 하고 있는 경우나 데이터 기반의 의사결정을 내리는 경우. 혹은,  인공지능(AI)/기계학습(ML)에 기반한 새로운 연구개발 모델을 위한 경우에도 데이터는 쉽게 사용할 수 있어야 하며 그 데이터의 콘텍스트를 이해할 수 있어야 한다는 두 가지 전제조건이 필수입니다.

데이터의 콘텍스트를 이해하는 것은 데이터 지능(Data Intelligence)의 기본이며 데이터 기반의 연구개발을 실현하기 위한 열쇠가 될 것입니다.

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CHALLENGES

Dotmatics는 가능합니다.

AI/ML에 적합합 데이터

데이터 과학자는 부서, 분야, 헙엽 등의 소스에 신경 쓸 필요 없이 실험의 상황을 정직하게 반영한 신뢰성 높은 연구 데이터를 필요로 합니다.

의사결정에 적합한 데이터

관리자는 작성 및 확인이 쉬운 최신 대시보드나 업데이트된 리포트로 프로젝트 진척상황을 명확하게 파악해야합니다.

다음 실험을 계획에 적합한 데이터

과학자는 이전 경험의 실패와 성공으로부터 배워야 합니다. 이전에 무엇이 성공했는지, 어떤 단계가 성공으로 이어지는지 파악해야 합니다.

CAPABILITIES

Dotmatics와 함께하세요.

icon 워크플로우와 기능에 따라 데이터를 컨텍스트화

R&D데이터에서 가치를 찾는것이 왜 어려울까요? 생명과학 및 화학, 재료분야의 많은 연구원들이 R&D데이터를 기록하고 관리하는 인프라에 많은 투자를 하고 있습니다. 하지만 데이터를 검색할 때 컨텍스트가 손실되는 경우가 있어 원하는 결과를 얻지 못할수도 있습니다.

Dotmatics는 다양한 데이터 유형을 통합하는  데이터중심의 플랫폼으로 워크플로우나 기능에 따라 사용 권한을 조정할 수 있습니다. 예를 들어 테크니션들은 특정 실험에 관련된 데이터만 볼 수 있고 연구원는 특정 실험을 구성하는 데이터 전체를 분석할 수 있습니다.

icon 복잡한 실험을 위한 쿼리데이터

특정 실험에 관한 모든 데이터에 대한 액세스 권한을 가질 수 있으며 다양한 방법으로 데이터를 탐색할 수 있습니다. 분석에 관계없는 데이터로 사용자에게 부담을 주지 않고 관련된 모든 데이터를 한 곳에서 확인할 수 있습니다.

Dotmatics의 솔루션은 항체 스크리닝과 같은 고도로 표준화된 실험부터 재료과학과 같은 다양성이 높은 실험까지 다양한 분야의 실험에 적용할 수 있습니다. 화학, 생물학, 제제, 프로세스, 분석/물리적 특성평가 데이터를 상호 참조가 가능한 유연한 프레임워크를 제공하여 연구 데이터의 전체를 파악할 수 있습니다.

icon 지식의 추출과 중복실험 방지

Dotmatics의 솔루션은 실험에 관련된 모든 데이터를 기록하고 액세스 할 수 있을 뿐만 아니라 각 단계의 중간 생성물이나 반응을 분석하여 실험이 어떻게 성공했는지 이해하고 파악할 수 있습니다. 프로젝트의 내용이 과거의 연구와 비슷한 경우에는 관련된 실험을 모아 최적의 시작점 찾을 수 있으며 동일한 실험의 중복을 피해 비용을 절감할 수 있습니다.

icon 데이터 시각화 및 의사결정 지원

데이터시각화는 데이터 지능(Data Intelligence)의 핵심으로 데이터를 지식으로 바꾸는 중요한 과정입니다. 많은 사람들은 데이터 시각화를 최종산물로 보고 있지만 Dotmatics의 Vortex에서는 연구자들의 통찰을 플랫폼에 다시 반영을 할 수 있습니다. 이를 통해 데이터 관리에서 중요하며 의사결정을 지원하거나 새로운 프로젝트의 기반을 다질 수 있습니다.

icon 플랫폼 설계의 유연성

Dotmatics 통합 플랫폼은 standalone이나 솔루션으로 배포하여 LIMS나 ELN같은 다양한 트랜잭션 시스템과 통합하여 연구 데이터를 가치있는 자산으로 전환하여 혁신을 가속화 할 수 있습니다. 통합을 통해 다양한 데이터 사일로를 하나로 묶거나 다양한 분야(화학 합성, 포뮬레이션, 공정 및 분석/물리적 특성화)에 걸친 데이터의 통합도 가능합니다. 기기데이터 수집 및 전처리 과정 등의 애플리케이션 수준의  통합으로 워크 플로우를 간소화 할 수 있습니다

Products

솔루션 구현을 위한 제품 리스트

iconDotmatics Browser

Dotmatics Browser는 강력한 웹기반 검색 및 리포팅 솔루션으로 Dotmatics 및 타사의 연구 데이터베이스에서 통합 검색을 제공하여 연구원들이 필요할 때 언제든 데이터 저장 위치에 상관없이 모든 데이터에 접근할 수 있습니다.

Browser로 무엇을 할 수 있나요?

  • 화학, 생물, 어세이, 연구노트 및 기타 연구 데이터베이스를 통합하여 단일 화면에 통합 검색 및 탐색 기능을 제공합니다.
  • 화학 구조의 하부 구조 및 유사성 같은 과학적 검색을 제공합니다.
  • 프로젝트 수준 및 개인에 따른 검색 양식 및 보기, 검색 내역, 목록 및 보고서를 관리합니다.
  • 양식, 표 및 차트로 강력한 데이터 시각화를 구현합니다.

iconBlueprint

Blueprint는 웹 기반의 시각화 및 과학 분석 어플리케이션입니다. 이는 small molecule 프로젝트에 참여하는 연구원들의 데이터 시각화 및 분석과 화합물 연구를 지원하여 다음에 만들 화합물을 설계하는 데 도움을 줄 수 있도록 만들었습니다.

Blueprint로 무엇을 할 수 있나요?

  • 데이터 분석 비전문가인 실무연구원들이 데이터분석툴에 하루종일 얽매이지 않도록 간단한 가이드를 제공하는 웹 유저인터페이스
  • 분자데이터셋을 탐색하도록 과학데이터를 차트나 테이블 및 그리드를 사용하여 시각화
  • SAR 데이터셋을 이해하기 위한 큐레이션된 화학계산 및 화학정보학 분석 워크플로우 내장
  • Workspace 공유를 통한 커뮤니케이션 가능
  • Dotmatics 제품군과 완벽한 통합
    • Browser : 프로젝트 데이터 수집
    • Reaction Workflow : 라이브러리와 화합물들 디자인
    • Vortex : 심층적 ad-hoc 분석

iconDotmatics Studies Notebook

  • Dotmatics Studies Notebook (ELN)은 모든 과학 분야의 실험 데이터 수집, 저장 및 검색 할 수 있는 유연한 템플릿 기반 전자 연구 노트 (ELN)입니다.

    Studies Notebook으로 무엇을 할 수 있나요?

    • 연구원들은 Dotmatics Studies Notebook을 사용하여 모든 팀원이 쉽게 검색 할 수 있는 형태로 실험 데이터를 수집하고 저장할 수 있습니다. 또한, Dotmatics Studies Notebook 을 통해 지적재산권 보호 및 감사 오딧을 하고 서명 절차를 정의 할 수 있습니다.​
    • 템플릿으로 구현되는 유연한 프로토콜을 통해 합성 화학 및 단백질 정제와 같은 고도로 구조화 된 실험 뿐만 아니라 생물학 실험을 통한 표적 식별 및 개발에서 유용한 ad-hoc 형태의 실험을 수용합니다. Ad-hoc은 종이 기반 연구노트에서 전자연구노트로 전환시에 종종 사용됩니다.​
    • Dotmatics Studies Notebook을 사용하면 조직 내 혹은 조직의 여러 연구원이 공동 연구를 수행 할 수 있습니다.​

iconDotmatics Vortex

Vortex는 과학적 의사결정을 지원하기 위한 대화형 데이터 시각화 및 분석 솔루션입니다. 스프레드시트 패러다임을 구축하고 확장하여 데이터의 복잡성과 크기를 탐색하고 이해하는데 필요한 데이터 조작, 통계 분석 및 정교한 그래프 기능을 제공합니다.​ Vortex는 과학적으로 화학 정보학과 생물 정보학 분석 및 시각화 기능을 제공하고 있습니다.​

Dotmatics Vortex로 무엇을 할 수 있나요?

  • 사용자가 크고 복잡한 데이터를 이해하고 수정및 선택할 수 있음.​
  • 팀은 공유 가능한 workspace와 재사용 가능한 템플릿을 통해 과학적 분석에 대한 협업이 가능
  • 숫자, 텍스트, 이미지, 화학 구조 및 생물학적 서열 데이터를 이해
  • 차트 및 테이블을 포함한 고성능의 대화형 데이터 시각화를 생성
  • 수천 개의 데이터 설명 혹은 전체 유전체 서열을 포함한 세포로 된 수 백만개의 화합물 테이블 같은 매우 큰 데이터 세트를 처리
  • 데이터 마이닝, 통계, 화학 정보학 및 생물 정보학 분석 기능이 내장
  • 여러 유형의 파일 또는 Browser 검색 데이터를 불러오거나 데이터베이스 직접 데이터를 불러올 수 있음.

iconDotmatics Platform

Dotmatics Platform은 Dotmatics의 웹기반의 과학 애플리케이션을 지원하하고 이들이 함께 작동하여 사용자에게 원활한 end-to-end 워크플로우를 제공하는 공통 프레임워크입니다. Platform은 클라우드에서 관리하는 배포나 자온프레미스에서 체지원해야하는 배포를 지원한다. 개방형 아키텍처를 통해 워크플로우에 타사의 소르트웨어를 통합할 수도 있습니다. Platform을 “Dotmatics Browser”와 함께 사용하면 기업 및 외부 연구 데이터에 관한 연합 데이터로 할 수 있습니다. Dotmatics Platform은 완전히 통합되어 각각의 애플리케이션의 기능을 포괄하는 비즈니스 워크플로우를 지원하기 위해 공통적 데이터 모델이나 코드 및 아키텍처를 제공합니다. 이는 유지보수 및 개발에 있어 용이하고, 연구기관의 확장에 있어서도 중요합니다. 이를 통해 여러 개발이력을 다양한 개발이력을 가진 여러 테크놀로지 및 아키텍처와 긴밀하게 통합되지 않은 어플리케이션을 지원하는 다른 플랫폼과 비교할 경우 총소유비용(TCO)을 최소화할 수 있습니다.

 

  • 모든 Dotmatics의 웹 기반 과학 애플리케이션을 지원하는 프레임워크를 제공하고 서로 연동하여 원활한 워크 플로우를 제공
  • 관리자가 사용자 및 그룹, 애플리케이션 및 구성을 관리 할 수 있는 포털
  • 타사 소프트웨어와의 자동화 및 통합을 위한 API를 제공​
  • Dotmatics Browser와 함께 사용하면 조직 전체 및 외부의 데이터에 액세스 가능

iconDotmatics Cloud

모바일 기술은 이동중에도 협업할 수 있으며, 데이터에 액세스하고 의사결정이 가능하기에 처리량을 증가시키고 검토 과정에 소요되는 시간을 줄여줍니다. 클라우드에서 실행하는 Dotmatics Platform은 다양한 시스템과 데이터 소스를 통합할 수 있습니다. Dotmatics Platform 고객들은 클라우드에서 실행되는 자체 인스턴스의 웹브라우저를 이용하여 모든 Dotmatics 솔루션으로 안전하게 액세스가 가능합니다. 이를 통해 사용자는 관련된 모든 내용을 포함한 정보를 볼 수 있으며, 이를 통해 정보에 입각한 연구와 비즈니스에 관련 의사결정이 가능합니다.

클라우드상의 Dotmatics Platform은 Amazon Web Services™(AWS)에 의해 구동됩니다. Gold standard인 AWS 인프라를 사용으로 데이터 보안을 보장합니다. Dotmatics의 솔루션은 전 세계의 Amazon이 관리하는 데이터 센터에 설치되어 사용자의 사용자가 원하는 위치에 데이터가 저장됩니다. Dotmatics 플랫폼은 다양한 분야의 그룹의 모든 과학데이터와 기능에 접근하기 위한 단일 액세스 지점을 제공합니다. 과학자, 공동 작업자 및 파트너는 위치나 시간에 관계없이 클라우드를 통해 서로 즉시 같은 데이터를 가지고 상호 소통을 통한 실시간으로 연구에 관한 약속을 이행할 수 있습니다.

  • 각각의 고객 데이터는 별도의 전용 인스턴스에 보관
  • 인스턴스에 대한 액세스는 듀개의 방화벽 레이어와 사용자 인증으로 제어
  • 인스턴스와의 모든 트래픽은 2048 비트 GlobalSign 인증서를 사용하여 암호화된 HTTPS / SSL
  • 모든 인스턴스는 중앙에서 관리되는 Trend Micro Antivirus 소프트웨어를 실행

공동 연구의 핵심

  • Dotmatics 플랫폼과 결합된 Dotmatics Cloud는 공동 연구 수행 방식을 혁신
  • Dotmatics의 유연하고 포괄적인 플랫폼은 프로젝트 사용자에게 안전한 액세스를 제공합니다
  • 단순한 파일 공유뿐만 아닌 아이디어 생성 솔루션
  • 전 세계의 내부 및 외부 연구개발팀이 데이터를 공유하고 새로운 이슈를 제기하며 혁신적인 아이디어와 지적재산을 창출

iconDotmatics Chemselector

Dotmatics Chemselector manages very large chemistry datasets with fast search and trivially simple maintenance/update. It has a modern user interface focused on browsing and filtering for molecule, reagent and sample selection. The available eMolecules+ for Chemselector dataset provides access to highly curated eMolecules sourcing data.

Chemselector 

  • High performance chemical searching, filtering and selection designed to support critical medicinal and synthetic chemistry workflows including:
    • building block selection
    • fragment set design
    • screening molecule selection for scaffold hopping
    • chemical series validation for hit to lead campaigns (“SAR by catalog”)
  • Uses Dotmatics provided datasets such as eMolecules+ for Chemselector and ChEMBL for Chemselector, or datasets built in-house from corporate or public databases

eMolecules+ for Chemselector

  • A sourcing dataset of over 20 million compounds and 8 million unique chemical substances with availability, pricing and packaging information from hundreds of suppliers using data curated by eMolecules
  • Provides additional information to the eMolecules source data to enhance searching, including deprotected structures, calculated physicochemical properties and structure classes
  • Simple monthly updates provide the latest eMolecules supplier and catalog data

iconDotmatics Cascade

Dotmatics Cascade manages the requesting and assignment of laboratory tasks, and tracking the progression of samples, across multiple teams within an organization or across a collaborating network.

  • Dotmatics Cascade allows organizations to define available services, such as assay execution or analysis and the associated scientific team
  • Scientists create requests for services and submit compounds Service managers manage, group and assign requests for execution
  • Service team scientists accept requests, create and autopopulate experiments to execute them
  • Teams can see request status and monitor compound or sample progression

iconDotmatics Reaction Workflows

Dotmatics Reaction Workflows is a graphical environment that enables scientists to build and execute data processing workflows to perform common cheminformatics tasks, such as library enumeration, structure normalization and compound profiling. Users build workflows in a drag-and-drop environment by selecting and connecting nodes that provide inputs (e.g a list of reagents) and outputs (e.g. view in Dotmatics Vortex) or perform actions (e.g. perform a reaction), configuring them with data and then executing the workflow to produce results. Many different tasks can be configured including:

  • Synthetic library enumeration for an ELN experiment
  • Virtual library enumeration and profiling for virtual screening
  • Structure normalization for registration
  • Idea generation via lead hopping or to avoid liabilities
  • Chemistry file clean up

iconDotmatics Inventory

Dotmatics Inventory is a fully searchable sample and materials inventory that tracks chemicals, biologics, instruments and associated data across a hierarchy of locations and manages the dispensing and plating workflows, as samples are moved through an R&D process.

  • Defines a hierarchy of storage locations for an organization
  • Track samples in containers such as bottles and plates in those storage locations
  • Manages research materials, reagents and assets
  • Manages the aliquoting and dispensing workflows to distribute samples for testing
  • Maintains a full audit trail
  • Allows for searching and reporting on inventory information alongside other corporate data

iconDotmatics Pinpoint

Dotmatics Pinpoint is a chemical cartridge for indexing and searching chemistry within Oracle databases.

Pinpoint enables indexing of chemical structures, calculations of physical chemical properties and substructure searches within an Oracle database. It is used to support structure searching with Dotmatics Browser, check for structural uniqueness and register molecules in Dotmatics Register, and store and search chemical reactions in Dotmatics Studies Notebook.

iconDotmatics Elemental

Dotmatics Elemental is a chemical sketcher that enable scientists to draw, edit and save structures and reactions, and calculate properties.

  • Sketch molecules, reactions and structure queries
  • Calculate chemical properties
  • Available as a fully-featured desktop application, iOS app or lightweight JavaScript plugin for sketching in-line in webpages

iconDotmatics Register

Dotmatics Register is a web-based compound and batch registration system used to maintain corporate chemical registration and reagent databases.

  • Captures chemical structure and associated data for newly synthesized or acquired compounds
  • Determines uniqueness and assigns new corporate IDs and/or new batch/lot IDs
  • Allows for single compound or batch registration
  • Allows registration from its own UI or from an ELN (Dotmatics or third party)