공동 네트워크 연구를 위한 Dotmatics 솔루션

외부와의 협업 수행

OVERVIEW

내·외부 협업연구 프로젝트에서 데이터 효율성 최적화

오늘날의 연구 종종 프로젝트는 제약, 생명공학, CRO 및 학술기관 등의 협업 네트워크를 통해 수행됩니다. 프로젝트는 유료 서비스에서부터 공동 지적재산권에 대한 연구개발, 대규모 컨소시엄에 이르기까지 다양합니다. 많은 기업이 이러한 프로젝트에 크게 투자 했지만 공동 연구 네트워크 전체의 정보 흐름을 최적화하는데는 어려움을 겪고 있습니다. 이메일, 파일 공유 및 리포트를 통해 작업을 요청하고 결과를 공유하는 경우가 대부분입니다. 이로 인해 처리 시간이 길어지고 데이터 기록 및 해석에 있어 오류가 발생할 수 있습니다. 이는 혁신을 지연시키고 외부 협업으로의 전환에 대한 예상 투자 수익에 부정적인 영향을 미칩니다.

협업 네트워크 연구를위한 Dotmatics 솔루션은 어떤 타기관의 프로젝트든 성공할 수 있도록 도움을 줄 수 있습니다. 실시간 과학 데이터 교환, 정보에 입각한 프로젝트 관리 및 파트너간에 과학적 의사 결정을 공유합니다.

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CHALLENGES

Dotmatics는 가능합니다.

데이터 공유 및 보안

모든 프로젝트에는 연구 프로젝트 데이터를 신뢰할 수 있는 소스가 있어야 합니다. 프로젝트팀의 모든 구성원은 자신에게 접근권한이 있는 데이터에 언제든 액세스 할 수 있어야합니다. 이를 통해 프로젝트 진행에 대해 가장 현명한 결정을 빠르게 내릴 수 있습니다.

데이터 교환 및 요청

작업 요청 및 실험 결과의 공유는 실시간으로 이루어져야 하며 사람이 직접 파싱(parsing) 해야하는 일을 줄여 작업속도를 빠르게 하며 정확도를 향상시킵니다.

프로젝트 권한설정

연구개발 프로젝트는 다양한 사람에 의한 연구가 모두 기록되어야 하기 때문에 파트너들을 쉽게 추가하고 삭제를 할 수 있어야 합니다. 파트너의 권한설정 및 해제를 간단하게 실시간으로 반영할 수 있어야 합니다.

IP 보호

프로젝트 결과에 대한 법률적 문제 및 지적재산권의 소유권에 대한 문제는 복잡 할 수있습니다. 이메일 및 보고서에서 데이터를 복사하고 공유하면 추적이나 지적재산권을 보호하기가 힘듭니다. 모든 프로젝트 작업은 감사되어야 하고 지적재산권은 프로젝트 중에도 보호되어야하며 최종적으로는 쉽게 배포 할 수 있어야합니다.

Decision support

공동의 개발 프로젝트에서는 네트워크 파트너와 함께 결정을 내릴일이 많습니다. 일관된 의사 결정을 위해 공통된 프로젝트 데이터 보기와 공통된 분석을 기반으로해야합니다.

프로젝트 관리

프로젝트 관리자는 작업 상태 및 프로젝트 진행 상황에 실시간으로 액세스 할 수 있어야합니다. 이를 통해 진행 상황을 이해하고 향후 작업의 우선 순위를 적절한 시기에 결정할 수 있습니다.

CAPABILITIES

Dotmatics와 함께하세요.

icon 호스팅 협업 플랫폼 보유

Dotmatics 솔루션은 클라우드에서 안전하게 호스팅되므로 방화벽 외부의 모든 파트너가 액세스 할 수 있습니다. 프로젝트 구성원은 신속하게 접근할 수 있으며, VPN 액세스가 필요하지 않습니다. 필요한 경우, 데이터 및 실험을 회사의 기존 정보학 애플리케이션 (예 : 구버전의 설치형)에 동기화 할 수 있습니다.

icon 실시간 과학 데이터 교환

이 솔루션은 분자, 서열, 분석, 실험 및 이미지는 물론 텍스트 등의 과학적 데이터의 저장소를 제공합니다. 이는 프로젝트 내의 각 데이터 유형에 대한 단일 소스를 제공합니다.

보안은 데이터에 대한 각 파트너의 세분화된 액세스를 정의하며 모든 파트너는 실시간으로 권한이 부여 된 모든 데이터에 액세스 할 수 있습니다.

icon 파트너 간 과학적 워크 플로 허용

Dotmatics 애플리케이션은 실험, 분자 및 생물학적 개체, 샘플 및 분석 결과를 공유 저장소에 직접 기록 할 수 있습니다. 저분자에서 펩티드, 항체, 접합체(conjugates) 및 공학적 생물학적 제제에 이르기까지 광범위한 치료제 연구가 지원됩니다.

작업 요청 기능 및 실험 전송을 통해 한 팀에서 다른 팀으로 작업을 요청할 수 있습니다.

공유 의사 결정 지원 도구를 사용하면 모든 사용자들은 동일한 분석 및 동일한 화면에서의 시각화가 가능하여 이를 바탕으로 다른 팀도 의사 결정을 내릴 수 있습니다.

icon 프로젝트 관리 및 성과 모니터링

프로젝트 관리자는 작업을 할당하고, 작업 요청 상태를 추적하고, 실험을 통해 진행 상황을 모니터링 할 수 있습니다. 실시간 프로젝트 상태에 액세스하여 프로젝트 방향을 보다 효율적으로 추진하기 위해 시기에 맞는 적절한 결정을 내릴 수 있습니다.

icon 데이터 자동화

Dotmatics 플랫폼을 Dotmatics의 BioBright 솔루션과 함께 사용하면 파트너에서 공유 보안 데이터 레이크로 파일을 직접 업로드 할 수 있습니다. 데이터 및 메타 데이터를 추출하기 위해 자동으로 파싱(parsing)할 수 있으며 유효성 검사 규칙을 실행할 수 있습니다. 그런 다음 데이터를 ELN 또는 분석 실험으로 자동 전송하거나 ELN 사용자가 데이터 레이크에서 직접 추가 할 수 있습니다.

사례 연구

Antabio에서의 웹기반의 정보학 솔루션 도입

사례연구 자세히 읽기
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Products

솔루션 구현을 위한 제품 리스트

iconDotmatics Studies Notebook

Dotmatics Studies Notebook (ELN)은 모든 과학 분야의 실험 데이터 수집, 저장 및 검색 할 수 있는 유연한 템플릿 기반 전자 연구 노트 (ELN)입니다.

Studies Notebook으로 무엇을 할 수 있나요?

  • 연구원들은 Dotmatics Studies Notebook을 사용하여 모든 팀원이 쉽게 검색 할 수 있는 형태로 실험 데이터를 수집하고 저장할 수 있습니다. 또한, Dotmatics Studies Notebook 을 통해 지적재산권 보호 및 감사 오딧을 하고 서명 절차를 정의 할 수 있습니다.​
  • 템플릿으로 구현되는 유연한 프로토콜을 통해 합성 화학 및 단백질 정제와 같은 고도로 구조화 된 실험 뿐만 아니라 생물학 실험을 통한 표적 식별 및 개발에서 유용한 ad-hoc 형태의 실험을 수용합니다. Ad-hoc은 종이 기반 연구노트에서 전자연구노트로 전환시에 종종 사용됩니다.​
  • Dotmatics Studies Notebook을 사용하면 조직 내 혹은 조직의 여러 연구원이 공동 연구를 수행 할 수 있습니다.​

iconDotmatics Studies

Dotmatics Studies는 매우 유연하고 혁신적인 스크리닝 데이터 관리 솔루션으로, HCS 및 HTS에서 용량 반응 (dose-response) 및 DMPK 연구에 이르기까지 모든 유형의 스크리닝 실험을 저장하고 분석합니다.

Studies로 무엇을 할 수 있나요?

  • Plate 및 non-plate 기반 어세이에 대한 분석 프로토콜을 정의​
  • 즉시 사용 가능하(OOTB)거나 사용자 맞춤의 어세이 프로토콜, Curve fit 계산, Plate reader 및 기록 및 저장시 재사용 할 수 있는 plate 레이아웃을 제공​
  • 많은 양의 데이터 어세이도 지원합니다.​
  • 결과 분류의 자동화를 위한 비즈니스 규칙을 정의​
  • 수동 또는 자동 처리를 통해 스크리닝 분석하는 연구원은 스크리닝 프로토콜을 적용하여 기기의 raw 데이터를 처리하고 결과를 검증하거나 실험 생성 및 처리를 자동화 레이어를 통해 구동
  • 분석을 완료되고 검증이 끝나면, 검색 결과는 Browser를 통해 프로젝트 팀에게 즉시 제공됩니다.​

iconDotmatics Browser

Dotmatics Browser는 강력한 웹기반 검색 및 리포팅 솔루션으로 Dotmatics 및 타사의 연구 데이터베이스에서 통합 검색을 제공하여 연구원들이 필요할 때 언제든 데이터 저장 위치에 상관없이 모든 데이터에 접근할 수 있습니다.

Browser로 무엇을 할 수 있나요?

  • 화학, 생물, 어세이, 연구노트 및 기타 연구 데이터베이스를 통합하여 단일 화면에 통합 검색 및 탐색 기능을 제공합니다.
  • 화학 구조의 하부 구조 및 유사성 같은 과학적 검색을 제공합니다.
  • 프로젝트 수준 및 개인에 따른 검색 양식 및 보기, 검색 내역, 목록 및 보고서를 관리합니다.
  • 양식, 표 및 차트로 강력한 데이터 시각화를 구현합니다.

iconDotmatics Cloud

모바일 기술은 이동중에도 협업할 수 있으며, 데이터에 액세스하고 의사결정이 가능하기에 처리량을 증가시키고 검토 과정에 소요되는 시간을 줄여줍니다. 클라우드에서 실행하는 Dotmatics Platform은 다양한 시스템과 데이터 소스를 통합할 수 있습니다. Dotmatics Platform 고객들은 클라우드에서 실행되는 자체 인스턴스의 웹브라우저를 이용하여 모든 Dotmatics 솔루션으로 안전하게 액세스가 가능합니다. 이를 통해 사용자는 관련된 모든 내용을 포함한 정보를 볼 수 있으며, 이를 통해 정보에 입각한 연구와 비즈니스에 관련 의사결정이 가능합니다.

클라우드상의 Dotmatics Platform은 Amazon Web Services™(AWS)에 의해 구동됩니다. Gold standard인 AWS 인프라를 사용으로 데이터 보안을 보장합니다. Dotmatics의 솔루션은 전 세계의 Amazon이 관리하는 데이터 센터에 설치되어 사용자의 사용자가 원하는 위치에 데이터가 저장됩니다. Dotmatics 플랫폼은 다양한 분야의 그룹의 모든 과학데이터와 기능에 접근하기 위한 단일 액세스 지점을 제공합니다. 과학자, 공동 작업자 및 파트너는 위치나 시간에 관계없이 클라우드를 통해 서로 즉시 같은 데이터를 가지고 상호 소통을 통한 실시간으로 연구에 관한 약속을 이행할 수 있습니다.

  • 각각의 고객 데이터는 별도의 전용 인스턴스에 보관
  • 인스턴스에 대한 액세스는 듀개의 방화벽 레이어와 사용자 인증으로 제어
  • 인스턴스와의 모든 트래픽은 2048 비트 GlobalSign 인증서를 사용하여 암호화된 HTTPS / SSL
  • 모든 인스턴스는 중앙에서 관리되는 Trend Micro Antivirus 소프트웨어를 실행

 

공동 연구의 핵심

  • Dotmatics 플랫폼과 결합된 Dotmatics Cloud는 공동 연구 수행 방식을 혁신
  • Dotmatics의 유연하고 포괄적인 플랫폼은 프로젝트 사용자에게 안전한 액세스를 제공합니다
  • 단순한 파일 공유뿐만 아닌 아이디어 생성 솔루션
  • 전 세계의 내부 및 외부 연구개발팀이 데이터를 공유하고 새로운 이슈를 제기하며 혁신적인 아이디어와 지적재산을 창출

iconDotmatics Register

Dotmatics Register is a web-based compound and batch registration system used to maintain corporate chemical registration and reagent databases.

  • Determines uniqueness and assigns new corporate IDs and/or new batch/lot IDs
  • Allows for single compound or batch registration
  • Allows registration from its own UI or from an ELN (Dotmatics or third party)

iconDotmatics Inventory

Dotmatics Inventory is a fully searchable sample and materials inventory that tracks chemicals, biologics, instruments and associated data across a hierarchy of locations and manages the dispensing and plating workflows, as samples are moved through an R&D process.

  • Defines a hierarchy of storage locations for an organization
  • Track samples in containers such as bottles and plates in those storage locations
  • Manages research materials, reagents and assets
  • Manages the aliquoting and dispensing workflows to distribute samples for testing
  • Maintains a full audit trail
  • Allows for searching and reporting on inventory information alongside other corporate data

iconDotmatics Cascade

Dotmatics Cascade manages the requesting and assignment of laboratory tasks, and tracking the progression of samples, across multiple teams within an organization or across a collaborating network.

  • Dotmatics Cascade allows organizations to define available services, such as assay execution or analysis and the associated scientific team
  • Scientists create requests for services and submit compounds Service managers manage, group and assign requests for execution
  • Service team scientists accept requests, create and autopopulate experiments to execute them
  • Teams can see request status and monitor compound or sample progression

iconDotmatics Blueprint

  • Simple guided web user interface designed for bench scientists who are not data analysis experts and may not spend all day, every day in data analysis tools 
  • Interactive visualization of scientific data with charts, tables and grids designed to explore molecular datasets  
  • A carefully curated set of the more important workflows for chemistry calculations and cheminformatics analytics to understand SAR data sets 
  • Enables communication through shared workspaces 
  • Seamless integration to the Dotmatics suite: 

iconDotmatics Reaction Workflows

Dotmatics Reaction Workflows is a graphical environment that enables scientists to build and execute data processing workflows to perform common cheminformatics tasks, such as library enumeration, structure normalization and compound profiling. Users build workflows in a drag-and-drop environment by selecting and connecting nodes that provide inputs (e.g a list of reagents) and outputs (e.g. view in Dotmatics Vortex) or perform actions (e.g. perform a reaction), configuring them with data and then executing the workflow to produce results. Many different tasks can be configured including:

  • Synthetic library enumeration for an ELN experiment
  • Virtual library enumeration and profiling for virtual screening
  • Structure normalization for registration
  • Idea generation via lead hopping or to avoid liabilities
  • Chemistry file clean up

iconDotmatics Chemselector

Dotmatics Chemselector manages very large chemistry datasets with fast search and trivially simple maintenance/update. It has a modern user interface focused on browsing and filtering for molecule, reagent and sample selection. The available eMolecules+ for Chemselector dataset provides access to highly curated eMolecules sourcing data.

Chemselector

  • High performance chemical searching, filtering and selection designed to support critical medicinal and synthetic chemistry workflows including:
    • building block selection
    • fragment set design
    • screening molecule selection for scaffold hopping
    • chemical series validation for hit to lead campaigns (“SAR by catalog”)
  • Uses Dotmatics provided datasets such as eMolecules+ for Chemselector and ChEMBL for Chemselector, or datasets built in-house from corporate or public databases

eMolecules+ for Chemselector

  • A sourcing dataset of over 20 million compounds and 8 million unique chemical substances with availability, pricing and packaging information from hundreds of suppliers using data curated by eMolecules
  • Provides additional information to the eMolecules source data to enhance searching, including deprotected structures, calculated physicochemical properties and structure classes
  • Simple monthly updates provide the latest eMolecules supplier and catalog data

iconDotmatics Elemental

Dotmatics Elemental is a chemical sketcher that enable scientists to draw, edit and save structures and reactions, and calculate properties.

  • Sketch molecules, reactions and structure queries
  • Calculate chemical properties
  • Available as a fully-featured desktop application, iOS app or lightweight JavaScript plugin for sketching in-line in webpages