Studies Notebook

Dotmatics Studies Notebook (ELN)은 모든 과학 분야의 실험 데이터 수집, 저장 및 검색 할 수 있는 유연한 템플릿 기반 전자 연구 노트 (ELN)입니다.

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Dotmatics Studies Notebook

유연한 전자연구노트

Dotmatics Studies Notebook (ELN)은 모든 과학 분야의 실험 데이터 수집, 저장 및 검색 할 수 있는 유연한 템플릿 기반 전자 연구 노트 (ELN)입니다.

Features

Overview

icon Studies Notebook으로 무엇을 할 수 있나요?

  • 연구원들은 Dotmatics Studies Notebook을 사용하여 모든 팀원이 쉽게 검색 할 수 있는 형태로 실험 데이터를 수집하고 저장할 수 있습니다. 또한, Dotmatics Studies Notebook 을 통해 지적재산권 보호 및 감사 오딧을 하고 서명 절차를 정의 할 수 있습니다.​
  • 템플릿으로 구현되는 유연한 프로토콜을 통해 합성 화학 및 단백질 정제와 같은 고도로 구조화 된 실험 뿐만 아니라 생물학 실험을 통한 표적 식별 및 개발에서 유용한 ad-hoc 형태의 실험을 수용합니다. Ad-hoc은 종이 기반 연구노트에서 전자연구노트로 전환시에 종종 사용됩니다.​
  • Dotmatics Studies Notebook을 사용하면 조직 내 혹은 조직의 여러 연구원이 공동 연구를 수행 할 수 있습니다.​

icon Studies Notebook의 이점

  • ​단순성 (Simple) –모든 실험 유형을 수용할 수 있는 직관적인 단일 프레임워크
  • 유연성 (Flexible) – 실험 유형을 정의하는 프로토콜은 데이터 작성을 위해 구조화된 양식부터 드래그 앤 드롭 파일 모음까지 다양
  • 과학적 (Scientific) – 분자, 반응, 시퀀스, 이미지, 비디오 및 텍스트 및 숫자를 포함한 과학 데이터 형식 및 관련 파일을 수집 및 저장
  • 지능형 (Intelligent) – 정교한 대시 보드와 실험 및 연구노트 네비게이션을 통해 관련 정보를 신속하게 찾고 조직의 연구에 대한 성과를 쉽게 파악
  • 연동 (Integrated) -​ Dotmatics Cascade의 업무 요청을 이용하여 직접 실험을 생성
  • Register에서 화학 물질등록을, Bioregister에서는 생물학적 물질의 등록이 가능
  • Dotmatics Browser에서 다른 Dotmatics 제품 또는 타사 데이터베이스의 데이터 통합검색​
  • 액세스 가능 – 클라이언트 설치없이 쉽게 배포 할 수 있는 웹 기반으로 실행. 회사 사내 서버 또는 클라우드에서 운영. 브라우저에 구애 받지 않으며 모바일 장치에서 사용가능
  • 협업 (Collaborative) – 클라우드 서버를 통해 외부와의 공동 작업을 지원하여 파트너 간에 실험 전송 가능

icon Studies Notebook의 주요한 기능 (General)

  • 모든 실험을 위한 공통 연구노트 프레임워크
  • 프로토콜은 다양한 실험 유형을 정의​
    • 프로토콜에는 다음이 포함 :​
    • 각 실험 인스턴스와 일치하는 데이터 필드를 위한 양식 기반 데이터 입력 섹션​
      • 매번 새로운 양식을 만들지 않고도 유니크한 연구를 기록 할 수 있는 Ad-hoc ( “paper-on-glass”) 데이터 입력 섹션​
      • 사무 문서, PDF, 화학 파일 (SD 파일, SMILES), 시퀀스 파일 (예 : FASTA, FASTQ), 이미지 및 비디오를 비롯한 다양한 파일을 Ad-hoc 섹션으로 직접 드래그앤 드롭
      • – 강력한 검색을 위해 파일의 데이터 (예 : xlsx, 분자, 시퀀스)를 데이터베이스로 파싱​
  • 인라인 텍스트 및 차트 섹션은 언제든지 추가 할 수 있습니다​
  • 데이터베이스의 데이터 보안 및 철저한 오딧​
  • 서명 및 부서(countersign) 절차 및 알림 설정​
  • 실험 완료 시 암호화 된 PDF​로 기록하고 저장
  • 공동 작업을 위한 연구원 간 실험 전달
  • 완전한 검색 지원​
  • 노트북, 실험 대시 보드 및 실험 계층별로 탐색​
  • Dotmatics SDMS 시스템에 연결하면 원격 으로 기기나 기계로부터의 문서나 데이터를 연구 노트 섹션에 추가
  • 타사 시스템의 자동화 및 연동을 위한 RESTful API​

 

icon Studies Notebook의 주요한 기능 (Chemistry) 화학

  • 합성 화학 protocol
    • Dotmatics Elemental 또는 타사의 드로잉 툴을 사용하여 구조 및 반응을 입력, 이전 실험의 반응이나 Reaxys와 같은 반응 데이터베이스에서 검색을 지원 (Reaxys 라이선스 필요)
    • 시약 입력 및 찾기
    • 화학량론 테이블 자동 계산 및 분자의 자동 명명
    • 반응 생산물은 노트북 페이지에서 직접 등록하고 샘플을 인벤토리에 추가
      • Dotmatics Register 및 Inventory로 바로 연동​
      • API를 통한 타사 물질등록 프로그램 또는 재고 관리 시스템에 연동​
    • 시약 / 제품 / 용매 등의 항목 정보에 대해 오토 텍스트 지원
    • QC 데이터 및 파일 기록​
    • 반응식을 통환 검색을 완벽히 지원​
    • Dotmatics Reaction Workflows와의 연동으로 라이브러리 enumeration에서 직접 라이브러리 합성을 위해 실험 노트를 직접 생성​
  • 분석 화학 프로토콜
    • 분석 요청 생성 및 관리​
    • 샘플 관리​
    • 분석 결과 확인​

icon Studies Notebook의 주요한 기능 (Biology) 생물학

  • 다양한 생물학적 실험을 지원하기 위해 미리 구성되어 있는 프로토콜을 사용할 수 있음.​
    • Discovery ELN 프로토콜은 정보 수집을 간소화하기 위한 초기 단계의 생물학 연구 및 생물학 연구를 위한 탐색활동을 지원​
    • 구조화된 프로토콜은 동물 면역화 및 단백질 생산 및 정제 워크플로우와 같은 명확하게 정의된 프로세스를 통해 사용자를 가이드하고 고품질의 구조화된 데이터 기록
  • Bioregister 및 Inventory와의 긴밀한 연동으로 엔티티의 정의 및 리소스를 ELN에서 직접 접근할 수 있어 다른 사용자 인터페이스로 컨텍스트 전환을 최소화 할 수 있으며, 이를 통해 워크 플로우가 간소화되고 연구원의 혼란을 최소화.
    • 실험에 활용할 데이터를 리소스에서 가져오기
    • ELN 페이지에서 직접 새 엔티티를 등록하거나 로그 배치(batch) 및 샘플을 inventory에 기록​

icon Studies Notebook의 주요한 기능 (Chemicals & Materials) 화학 및 재료

  • 다양하고 복잡한 재료 연구 워크플로우를 구현 – 유연하고 구성 가능한 프로토콜을 통해 구현
    • 고도로 표준화된 워크플로우를 위해 configuration을 기반으로 구축하고 인터페이스는 다음과 같은 특징을 가짐.
      • 집중하고 하는 바가 명확
      • 변경 관리 최소화​
      • 사용자 채택을 극대화​
    • 연구원은 연구 혁신을 위해 Ad-hoc 인터페이스는 디지털로 지적재산을 기록하고 관리하면서 기존의 전자연구노트에서 처럼 아이디어를 기록
  • 연구원이 기존의 연구 노트와 마찬가지로 IP를 디지털로 기록 및 관리
    • 관련 도메인 모델에 접속 – 데이터 기록 및 데이터 관리를 간소화
      • 모든 화학 산업 및 재료 과학 관련 데이터 유형 지원 :​
      • 합성 화학
      • 고분자
      • ​ 제형, 샘플,​
      • 분석 데이터 및 물리적 특성 데이터​
  • 지식과 모범 사례를 공유 할 수 있는 플랫폼 생성
    • Dotmatics의 연구 IT 플랫폼의 일부로 데이터 마이닝, 시각화 및 분석 애플리케이션을 지원​
    • 프로토콜 기반의 워크플로우는 전반적으로 조직의 모범 사례를 요약해서 공유하여 공동 연구 결과를 향상시키는 프레임워크를 형성