Bioregister

Bioregister는 생물물질의 정보를 저장하고, 지적재산권을 보호하며 단백질 생산공장 관리 등을 지원합니다.

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Overview

시퀀스 기반, 화학적 변형, 구조가 없는 물질 등록

Dotmatics의 Bioregister는 시퀀스 기반 및 화학적 변형 생물물질이나 구조가 없는 생물학적 엔티티 등록을 위한 웹 기반 응용 프로그램으로, 생물물질 신약개발 기관이 연구 엔티티 고유성을 보장하고 지적 재산을 보호 할 수 있습니다. Bioregister는 DNA, RNA, 펩타이드 및 단백질, 항체, conjugate, non-natural 펩타이드 및 뉴클레오티드, 플라스미드, 세포주 및 사용자가 정의 엔티티를 포함한 광범위한 생물 제제 엔티티들을 관리합니다. ​또한, 사용자는 정제 및 발현 정보,  기타 단백질 생산 데이터의 배치(batch) 및 샘플을 기록 할 수 있습니다.

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Features

Overview

icon Bioregister로 무엇을 할 수 있나요?

  • 화학적으로 변형된 서열 및 서열이 없는 물질, 관련 속성 데이터 및 계보를 포함한 생물학적 물질을 기록하고 관리합니다.​
  • 자연 및 비자연 엔티티의 화학적 표현 (가능한 경우)을 생성합니다.​
  • 엔티티의 고유성을 결정하고 등록 번호를 할당합니다.​
  • 단백질 발현, 정제 및 특성화와 같은 엔티티 생성과 관련된 데이터를 관리합니다.​
  • 완전한 관계 추적을 통해 엔티티에 대해 생성된 단백질의 배치(batch) 및 샘플을 기록합니다.

icon Bioregister의 이점 (Benefit)

  • 중요 연구 데이터의 관리를 중앙화하고 표준화하여 지적 재산을 보호하고 데이터 신뢰도를 향상​
  • 자연적(natural) 및 비자연적(non-natural) 엔티티에 대한 완벽한 화학적 표현을 포함하고 있어 보다 엄격한 고유성 검사 및 화학 기반 검색이 가능
  • 연구원들이 물질등록 데이터에, 빠르고 간단하게 양방향 액세스가 가능하여 워크플로우를 간소화하고 연구를 용이하게 함. 전자연구노트(ELN) 및 Inventory와 같은 다른 Dotmatics 애플리케이션과 완벽하게 연동되어 실험실의 워크플로우를 지원
  • 약물 후보 및 보조 동물, 세포주, 벡터 등과 같은 부수적인 엔티티를 포함하여 생물 제제 연구 와 관련된 모든 데이터를 관리. 새 항목을 정의하거나 기존 항목 정의 수정을 통해 확장이 가능; 속성이 다른 sub-type을 생성, 사용자가 고유성 규칙을 정의, 워크 플로우를 구성, 사용자가 monomer 라이브러리를 정의
  • 접근성 (Accessibility) – 클라이언트 설치없이 쉽게 접속 할 수 있는 웹 기반 솔루션. 회사 서버 및 클라우드 환경에서 접속하여 협업을 지원
  • 개방형 (Open) – RESTful API를 사용하면 타사 응용 프로그램에서 Bioregister 서비스를 호출​

icon Bioregister의 주요기능

시퀀스 관리​

  • 화학적으로 변형된 non-natural 잔기를 포함한 DNA, RNA, 작은 펩티드 및 단백질을 중앙화여 등록
  • Bioregister 화면 또는 Dotmatics Browser, Study Notebook (ELN), Inventory 혹은 Dotmatics외의 제품에서 공개된 웹서비스를 통해 간단하게 엔티티에 접근 할 수 있음.
  • 완전한 화학적 정의로 맞춤형 Monomer 라이브러리를 정의하고 대화식 편집기를 사용하여 Monomer 라이브러리에서 시퀀스를 작성할 수 있음.
  • Pistoia Alliance HELM 웹 편집기와 통합되어 HELM 형식의 natural 및 non-natural 시퀀스 생성 및 편집 가능
  • 엔티티-배치(batch)-샘플 계층을 포함하여 엔티티 계보 및 관련 엔티티 간 관계를 추적
  • 모든 엔티티 유형에 대한 오딧 추적 가능
  • 생물학적 conjugate를 위한 click chemistry 반응 지원
  • 개별 엔티티에서 컴플렉스를 만들고 등록
  • 일련의 점돌연변이 시퀀스를 빠르게 생성하기 위한 잔기 스캔 기능
  • 야생형 서열과의 추적 관계 또는 표준 (MSA) 알고리즘을 사용한 서열 정렬.
  • MW, PI 및 흡광 계수와 같은 속성을 자동으로 계산
  • 항체 넘버링 및 키메라와 같은 대체 넘버링 시스템에서 잔기/ 돌연변이를 처리
  • BLAST 또는 PROSITE를 사용하여 시퀀스를 검색​
  • 자동화된 메타 데이터 필드를 통한 효율적인 대량 등록 업무 간소화

단백질 생산 데이터 관리

  • 생물학적 서열과 연결된 전체 단백질 생산 공정을 통해 데이터를 관리
  • 중앙 집중식 데이터 스토리지를 사용하여 소중한 정보의 손실 방지
  • 발현 벡터, 단백질 태그, 발현 수준, 정제 프로토콜, 단백질 농도 및 순도를 추적
  • 필요에 따라 시스템을 사용자 정의하고 단백질 생산 공정의 각 단계와 함께 저장되도록 데이터 항목을 확장
  • blot, plot 및 프로토콜 설명에 대한 이미지를 포함하여 전체 프로세스에서 원하느 만큼 문서를 저장