ライフサイエンス研究

実験室のワークフローを最大限に効率化し、最適な意思決定を行うためのソリューション

概要

効率化とイノベーション

ライフサイエンスの研究は、学際的、マルチモーダル、データ中心型です。インフォマティクスのソリューションは、常に進化し続ける業界に追いつかなくてはなりません。

理想:

  • 開発チームのワークフローをサポートし、多様化する治療薬の種類に対応。
  • 研究が実験室内で行われている場合でも、複数の共同ネットワークで行われている場合でも、その効率を最大化。
  • 研究データの量と多様性、実験室の自動化に対応。
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チャレンジ

課題

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多様化する研究に対応

低分子、生物学的製剤、化学修飾された生物学的製剤、細胞療法、遺伝子治療薬の開発など、ライフサイエンスにおける研究は多様化しています。適切な意思決定を行うためには、幅広いエンティティや関連データを記録し、検索・分析する必要があります。

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共同研究

生物学的製剤の開発プロジェクトは、部門、科学分野、物理的な場所、時には会社を横断します。プロジェクトを効率的に遂行するためには、リクエスト、データ、結果がすべてのメンバー間でシームレスに流れる必要があります。

最適な意思決定

プロジェクトチームのすべてのメンバーは、保存場所に関係なく、許可を得たすべてのプロジェクトデータにリアルタイムでアクセスし、プロジェクトの進行に関する最適な意思決定を行う必要があります。

ワークフローの効率化

実験室のワークフローを効率化するためには、各役割のワークフローをシームレスに接続する統合ソリューションが必要です。また、実験装置からのデータ収集・分析を自動化し、部門横断的なワークフローに対応できるのが理想です。

特徴

ドットマティクスのソリューション

icon 部門横断的なワークフローに対応

創薬のワークフローは複雑で反復性が高く、企業内の異なるチーム間、または協力組織間で多くのハンドオフを必要とします。

ドットマティクスは、創薬ワークフローの全ステージに対応する包括的なソリューションを提供します。実験、エンティティ、サンプル、アッセイデータを記録するためのアプリケーションは、すべて共通のプラットフォーム上に構築されています。

このプラットフォームは、各ワークフローをシンプルなUIでシームレスに接続します。例えば、医薬品化学者や分子生物学者は、ELN(電子実験ノート)の操作画面から実験手順が記録でき、エンティティ情報を登録し、サンプル情報をサンプル管理システムに送信することもできます。

同様に、分析ワークフローもシンプルです。科学者は、すべての関連データを収集し、ひとつのアプリケーション内でデータを可視化・分析することができます。役割やチームをまたいで作業を行う場合は、作業依頼ツールで他のチームに作業を依頼し、進捗状況を確認することもできます。

icon 多様化する研究に対応

ドットマティクスのソリューションは、低分子、生物学的製剤、化学修飾された生物学的製剤、コンジュゲート、細胞療法等、幅広い分野の研究に対応します。

また、テキストや数値のデータに加えて、分子構造や生物学的な配列を理解する機能があるため、化学修飾された生物学的製剤の開発等、新しい治療薬の開発にも迅速に対応できます。

化学装飾された医薬品について詳しく見る

icon 実験、エンティティ、サンプル、アッセイデータを記録

ドットマティクスのソリューションは、実験室のワークフロー全体をデジタル化します。電子実験ノート(ELN)では、医薬品化学、分子生物学、分析科学などの幅広い実験の記録ができ、登録システムでは、生物由来エンティティ、化学装飾された生物由来エンティティ、コンジュゲート、低分子、または細胞株のような構造式ベースではないエンティティを登録することができます。また、親から生成されたエンティティの系統を追跡し、エンティティ間の関係を追跡することもできます。

サンプル管理システムでは、物理的なサンプルの場所と量を記録し、アッセイデータ管理システムに送信することができます。アッセイデータ管理システムは、ハイスループット、高含量、用量反応、Kinetic、DMPK実験に対応。すべてのデータは共通のプラットフォームに保存されるため、チームはすぐにデータにアクセスすることができます。

icon 実験室のデータ収集・分析を自動化

ドットマティクスのソリューションは、実験装置からデータを自動で収集し、データレイクに安全に保存することができます。また、収集したデータを解析してデータやメタデータを抽出し、検証を行うことができます。

ダッシュボードでは、進捗状況と結果を監視することができます。結果は電子実験ノートやアッセイデータ管理システムに直接送信することができます。ヒューマンエラーを排除した、リアルタイムでクリーンなデータはAI/MLで使用でき、科学者の意思決定に役立てることができます。このシステムは、今日の最高のスループットを誇る機器によって生成される膨大な数のファイルを処理するための拡張性を備えています

実験室のデジタル化について詳しく見る

icon データインテリジェンス

ドットマティクスのソリューションは、全データベースを横断した検索・参照が可能です。単一のビューを作成し、データのサイロ化を解消することができます。プロジェクトを横断した構造と配列の検索機能や可視化・分析ツールも利用できます。チームは共通のプラットフォーム上でデータを可視化できるため、十分な情報に基づいた迅速な意思決定を行うことができます。

データインテリジェンスについて詳しく見る

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icon 共同研究に最適

ドットマティクスのソリューションは、共同研究ネットワーク全体でのコラボレーションに最適です。実験や研究データはリアルタイムで共有でき、イベントフィードやダッシュボードには最新のステータスが表示されます。また、コラボレーションツールやコミュニケーションツールを使って共同研究を効率化することができます。

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ケーススタディ

LeadPharma の事例

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製品

このソリューションで使用する製品

iconDotmatics Browser

ドットマティクスの Browser は、強力な Web ベースの検索・レポーティングソリューションです。ドットマティクスおよびサードパーティの研究データベース全体を横断した検索ができ、保存場所に関係なく、必要なときにすべてのデータにアクセスできます。

  • 化学、生物学、アッセイ、実験ノート、その他の研究データベースを横断する検索と参照機能。
  • 部分構造や構造類似性などから検索ができます。
  • プロジェクトレベルおよび個人で、フォーム、ビュー、クエリ、リスト、レポートを作成できます。
  • フォーム、表、チャートで、科学データを可視化します。

iconDotmatics Studies Notebook

ドットマティクスのStudies Notebookは、幅広い分野の実験を記録、保存、検索するためのフレキシブルな電子実験ノート(ELN)です。

  • ドットマティクスのStudies Notebookは、科学者が実験を記録、保存でき、チームメンバー全員と簡単に共有できる電子実験ノート(ELN)です。また、IPの保護と監査が可能で、署名ワークフローを定義することもできます。
  • 合成化学やタンパク質精製などの高度に構造化された実験だけでなく、標的分子の同定や生物学的製剤開発のためのアドホックな実験にも対応。柔軟なテンプレートは、紙ベースの実験ノートからの移行をサポートします。
  • ドットマティクスのStudies Notebookがあれば、組織内または組織間で複数の科学者による共同作業が可能です。

iconDotmatics Bioregister

ドットマティクスのBioregisterは、シーケンスベースの生物由来エンティティ、化学修飾された生物由来エンティティ、構造式ベースではない生物由来エンティティを登録するためのWebベースのアプリケーションです。研究組織はエンティティの一意性を確保し、知的財産を保護することができます。

ドットマティクスのBioregisterは、DNA、RNA、ペプチド、タンパク質、抗体、コンジュゲート、非天然ペプチド、ヌクレオチド、プラスミド、細胞株、ユーザー定義の生物由来エンティティなど、幅広い生物由来エンティティの管理をサポートします。また、ユーザーは、これらのエンティティのバッチやサンプル、精製および発現情報、その他のタンパク質生成データを記録することができます。

  • 化学修飾された配列や構造式ベースではないエンティティ、関連する属性データや系統を含む生物由来エンティティを記録し、管理します。
  • 天然および非天然のエンティティの化学記述を生成します(可能な場合)。
  • エンティティの一意性を判断し、登録番号を割り当てます。
  • タンパク質の発現、精製、特性評価など、エンティティの生産に関連するデータを管理します。
  • 生産されたタンパク質のバッチとサンプルを記録し、関係性を追跡します。

iconDotmatics Register

Dotmatics Registerは、企業の化学物質や試薬データベースを管理するためのWebベースの化合物/バッチ登録システムです。

  • 合成・取得した化合物の化学構造と関連データを登録できます。
  • 一意性を判断し、新しい企業IDまたは新しいバッチ/ロットIDを割り当てます。
  • 単一化合物またはバッチ登録が可能です。
  • 独自のUIまたはELN(ドットマティクスまたはサードパーティ)からの登録を可能にします。

iconDotmatics Studies

ドットマティクスの Studies は、ハイコンテンツ(HCS)・ハイスループット(HTS)から用量反応・DMPKまで、あらゆるタイプのスクリーニング実験を記録および分析するための、スクリーニングデータ管理ソリューションです。

  • プレートベースおよび非プレートベースのアッセイの分析プロトコルを定義できます。
  • すぐに使えるアッセイプロトコル、カスタムアッセイプロトコル、カーブフィット計算、プレートリーダー、再利用できるプレートレイアウト機能。
  • 大容量のアッセイデータを管理。
  • 結果を自動で分類するためのルールを定義できます。
  • スクリーニングプロトコルを適用して結果の検証、実験の作成・処理を自動化。
  • 処理が完了して検証されると、スクリーニング結果は Browser を介してチームと共有されます。

iconDotmatics Vortex

ドットマティクスのVortexは、意思決定支援のための高度な科学データの可視化・解析ソリューションです。データ操作、統計分析、洗練されたプロット機能で、サイズの異なる複雑なデータを分析できます。ケムインフォマティクス、バイオインフォマティクスにも対応。

  • 大規模で複雑なデータセットの処理・精製ができます。
  • 共有可能なワークスペースと再利用可能なテンプレートが使用できます。
  • 数値、テキスト、画像、化学構造式、生物由来の配列データに対応。
  • チャートや表で、高性能でインタラクティブな可視化ができます。
  • 大規模なデータセットの処理ができます。数千の記述子による数百万の化合物の表や、全ゲノム配列を含むセルなど。
  • データマイニング、統計、ケミインフォマティクス、バイオインフォマティクス分析機能。
  • さまざまな種類のファイルからデータの読み込みが可能。Browserを併用すると、さまざまなデータベースからデータを直接読み込むことができます。

iconDotmatics Blueprint

Blueprintは、低分子創薬のためのWebベースのアプリケーションです。科学データを可視化および分析し、新しい化合物を設計することができます。

  • ベンチサイエンティスト向けに設計されたシンプルなガイド付きWebユーザーインターフェース。
  • チャート、表、グリッドで、科学データをインタラクティブに可視化します。
  • SARを理解するための化学計算やケムインフォマティクス分析のためのワークフローを提供します。
  • ワークスペースの共有が可能。
  • 他のドットマティクスのアプリケーションとシームレスに接続できます。
    • プロジェクトデータをまとめるBrowser
    • ライブラリや化学シリーズを設計するReaction Workflowsアドホック分析を可能にするVortex

iconDotmatics Platform

ドットマティクスのPlatformは、ドットマティクスのすべてのアプリケーションを構築するための共通のプラットフォームで、シームレスなエンドツーエンドのワークフローが構築できます。

ドットマティクスのPlatformは、クラウド、オンプレミスで展開が可能。オープンなアーキテクチャのため、ワークフローにサードパーティ製のソフトウェアを統合することができます。ドットマティクスの Browserを併用することで、企業内、外部のデータを横断参照することもできます。

ドットマティクスのPlatformは、1つのプラットフォーム上にある統合ソリューションです。共通のデータモデル、コード、アーキテクチャを使用しているため、メンテナンスとアップデートが簡単。複数の技術やアーキテクチャを持つアプリケーションのプラットフォームと比較して、総所有コストを低く抑えることができます。

  • 各ワークフローをシームレスに接続します。
  • 管理者は、ユーザー、グループ、アプリケーション、設定を管理できます。
  • 自動化とサードパーティ製のソフトウェアとの統合のためのAPIを提供します。
  • ドットマティクスの Browserを併用すると、企業内、外部のデータからの横断参照ができます。

iconDotmatics Chemselector

ドットマティクスのChemselectorは、簡単なメンテナンスとアップデートで非常に大規模な化学データセットの超高速検索ができます。ブラウジングとフィルタリングに焦点を当てた最新のユーザーインターフェースで化合物、試薬、サンプルを検索。eMolecules+ for Chemselectorでは、高度にキュレーションされたeMoleculesのデータセットが利用できます。

Chemselector

  • 高性能な検索、フィルター、選択機能で、以下のような医薬合成化学のワークフローをサポートします。
    • ビルディングブロックの選択
    • フラグメントセットデザイン
    • 足場ホッピングのためのスクリーニング分子の選択
    • hit to leadキャンペーンのための化学シリーズの検証
  • eMolecules+ for Chemselectorや、ChEMBL for Chemselectorなどのドットマティクスが提供するデータセット、または企業や公共のデータベース、社内で構築したデータセットが利用できます。

eMolecules+ for Chemselector

  • 何百ものサプライヤーから2000万以上の化合物と800万以上の化学物質の在庫情報、価格、包装情報を確認できます。
  • eMoleculesに追加情報を提供し、検索を強化することができます。
  • 最新のeMoleculesサプライヤーとカタログデータを提供します。

iconDotmatics Cascade

Dotmatics Cascade は、組織内の複数のチームまたは共同ネットワークを横断して、タスクのリクエストと割り当て、サンプルの進行状況を追跡・管理します。

  • アッセイの実行や分析などの利用可能なサービスと、それに関連するチームを定義することができます。
    科学者は、サービスのリクエストを作成し、化合物を提出することができます。サービスマネージャーは、実行リクエストを管理、グループ化、割り当てを行うことができます。
  • 科学者は、リクエストを受け付け、実験を作成し、自動入力して実行できます。
  • チームでリクエスト状況を確認し、化合物やサンプルの進行状況を確認することができます。

iconDotmatics Reaction Workflows

ドットマティクスの Reaction Workflows は、ライブラリのエニュミレーション、構造の正規化、化合物のプロファイリングなどの一般的なケムインフォマティクスのデータ処理ワークフローの構築と実行ができる、グラフィカルなアプリケーションです。

ユーザーは、入力(試薬リストなど)と出力(Dotmatics Vortexでのビューなど)、またはアクション(反応の実行など)のノードを選択し、ドラッグ&ドロップで簡単にワークフローを構築することができます。ドットマティクスの Reaction Workflows を使えば、以下のようなタスクが実行できます。

  • 合成ライブラリのエニュミレーション
  • 仮想スクリーニングのための仮想ライブラリのエニュミレーションとプロファイリング
  • 登録のための構造正規化
  • リードホッピング用の新しい分子の提案と分子の偏りの回避
  • 化学ファイルのクリーンアップ

iconDotmatics Inventory

Dotmatics Inventory では、サンプル・材料の在庫情報を確認することができます。化学物質、生物学的製剤、実験装置、その関連データを階層化して追跡し、サンプルが研究開発プロセスを経て移動する際のワークフローを管理することができます。

  • 保管場所の階層を定義できます。
  • ボトルやプレートなどの容器に入ったサンプルを保管場所で追跡できます。
  • 研究材料、試薬、アセットの管理ができます。
  • 検査用サンプルを分配するための分注ワークフローの管理ができます。
  • 監査証跡機能付き。
  • 他の企業データと併せて在庫情報を検索し、レポートを作成することができます。

iconDotmatics Pinpoint

Dotmatics Pinpointは、Oracleデータベース内の化学物質をインデックス化して検索するためのケミカル・カートリッジです。

  • Pinpointを使用すると、Oracleデータベース内の化学構造のインデックス作成、物理・化学的特性の計算、部分構造の検索が可能になります。
  • Dotmatics Browserで構造検索、Dotmatics Registerで構造の一意性をチェックして分子を登録、Dotmatics Studies Notebookで化学反応を保存して検索するために使用できます。

iconDotmatics Elemental

Dotmatics Elemental は、構造や反応式の描写・編集・保存・特性の計算ができる化学スケッチツールです。

  • 分子、反応式、構造をスケッチ
  • 化学的特性の計算
  • デスクトップアプリケーション、iOSアプリ、Webページのインラインスケッチのための軽量JavaScriptプラグインに対応