化合物設計

医薬品化学者・合成化学者向けの化合物設計ソリューション

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概要

低分子創薬におけるデータ駆動型の意思決定

低分子創薬のプロセスは、これまで以上にデータ駆動型になってきています。プロジェクトの進行に関する意思決定を行うための研究データの分析は、低分子創薬の各サイクルにおいて重要な活動となっています。化合物設計のためのドットマティクスのソリューションは、医薬品化学者や合成化学者向けに設計された分析ツールで、創薬プロセスの各サイクルを効率化。データサイエンティストや計算科学者の負担を軽減し、十分な情報に基づいた迅速な意思決定を行うことができます。

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チャレンジ

課題

医薬品化学者・合成化学者向けに設計されているか

通常、化合物設計のための可視化・分析ツールは、データサイエンティストや計算化学者向けに設計されています。このようなツールは強力ですが、専門知識を必要とするため、使用者が制限されることがあります。医薬品化学者・合成化学者自身が使用するために設計されたソリューションがあれば、十分な情報に基づいた迅速な意思決定を行うことができます。

シームレスなワークフロー

合成では多くの重要なワークフローがあります。プロジェクトのSARデータをすべて収集して整理し、可視化して分析。モデルを適用して意思決定を行い、新しい分子やライブラリを設計。 化学者は、この一連の業を、複数のアプリケーションを使い、データを手動で移動させながら進めるのではなく、シームレスなワークフローで進めるのが理想です。

意思決定を促進するリアルタイムデータ

プロジェクトの会議やレポートでは、研究データの静的なスクリーンショットを参考にすることがあります。しかし、スクリーンショットのデータは必ずしも最新ではないため、エラーが発生することがあります。データのレビューと意思決定の際は、プロジェクトチームのすべてのメンバーが、すべてのデータにリアルタイムでアクセスできる必要があります。

特徴

ドットマティクスのソリューション

icon 関連するすべてのデータを1つのビューで表示

データ分析において最も難しいのは、分析用の完全なデータセットを最初に組み立てることです。ドットマティクスの検索機能を使用すると、ドットマティクス、サードパーティ、企業内の全データベースから関連するすべてのデータを収集し、1つのビューで表示することができます。

ドットマティクスのソリューションがあれば、複数のアプリケーションで収集されたデータを手動で結合する必要がなく、関連するすべてのデータを自動で集めて分析することができます。検索は、オンデマンドで実行することも、スケジュールを設定して実行することもできます。

icon 科学データを可視化・分析するためのガイド付きWebアプリケーション

ドットマティクスの化合物設計ソリューションの中核には、医薬品化学者・合成化学者向けに設計された、ガイド付きの可視化・分析アプリケーションがあります。

特徴:

  • チャート、表、グリッドで科学データをインタラクティブに可視化し、分析できます。
  • プロパティ計算、プログラムメトリクス、R-group解析、Matched Molecular Pair(MMP)解析など、ケムインフォマティクスのための重要なワークフローを厳選。各ワークフローは、ガイドに沿って進めることができ、ユーザーは分析結果をステップbyステップで確認することができます。
  • ワークスペース、データセット、分析結果をチームで共有することができます。すべてのメンバーが全く同じデータから作業ができるため、チーム全体での意思決定を図ることができます。

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icon 新しい分子/シリーズ/ライブラリを設計、または購入可能な化合物/ライブラリを選択

ドットマティクスの化合物設計ソリューションでは、以下のことが可能です。

  • 合成ライブラリを設計およびエニュミレーションし、電子実験ノートに実験を自動的に作成。
  • プロファイリング、選択、または仮想スクリーニングのために、仮想ライブラリをエニュミレーション。
  • 化学変換を使用して、リードホッピング用の新しい分子を提案したり、分子の偏りを避ける。

試薬の大規模なデータベース(e-Molecules collectionなど)から、購入可能な試薬セットをすばやく特定できます。また、市販のスクリーニング化合物コレクションをフィルタリングし、購入する化合物を特定することもできます。

 

icon エンドツーエンドのワークフロー

すべてのデータを収集し、分析アプリケーションに読み込むプロセスは完全に統合されているため、ファイルを手動で移動する必要がありません。分析からデータセットブラウジングへのラウンドトリップも完全に統合されているため、分析中に分子のサブセットを選択し、新しいヒットリストとして返すこともできます。また、フォローアップアッセイパネルでスクリーニングを依頼することもできます。

合成ライブラリがエニュミレーションされると、データは分析アプリケーションに読み込まれます。合成するサブセットを選択すれば、ELNで実験を自動的に作成することができます。

icon 意思決定のためのリアルタイムデータ

プロジェクトの会議やレポートでは、研究データの静的なスクリーンショットを参考にすることがあります。しかし、スクリーンショットのデータは必ずしも最新ではないため、エラーが発生することがあります。

間違っている可能性のあるデータ、最新でないデータは、効果的なブレーンストーミングやリアルタイムの意思決定を妨げてしまいます。

ドットマティクスのソリューションがあれば、会議中でも最新のデータを確認できます。ビューをその場で調整し、リアルタイムのデータを確認することができ、効果的なブレーンストーミングや最適な意思決定を可能にします。

お問い合わせ

化合物設計ソリューション

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製品

このソリューションで使用する製品

iconDotmatics Browser

iconDotmatics Blueprint

Blueprintは、低分子創薬のためのWebベースのアプリケーションです。科学データを可視化および分析し、新しい化合物を設計することができます。

  • ベンチサイエンティスト向けに設計されたシンプルなガイド付きWebユーザーインターフェース。
  • チャート、表、グリッドで、科学データをインタラクティブに可視化します。
  • SARを理解するための化学計算やケムインフォマティクス分析のためのワークフローを提供します。
  • ワークスペースの共有が可能。
  • 他のドットマティクスのアプリケーションとシームレスに接続できます。
    • プロジェクトデータをまとめるBrowser
    • ライブラリや化学シリーズを設計するReaction Workflowsアドホック分析を可能にするVortex

iconDotmatics Reaction Workflows

ドットマティクスの Reaction Workflows は、ライブラリのエニュミレーション、構造の正規化、化合物のプロファイリングなどの一般的なケムインフォマティクスのデータ処理ワークフローの構築と実行ができる、グラフィカルなアプリケーションです。

ユーザーは、入力(試薬リストなど)と出力(Dotmatics Vortexでのビューなど)、またはアクション(反応の実行など)のノードを選択し、ドラッグ&ドロップで簡単にワークフローを構築することができます。ドットマティクスの Reaction Workflows を使えば、以下のようなタスクが実行できます。

  • 合成ライブラリのエニュミレーション
  • 仮想スクリーニングのための仮想ライブラリのエニュミレーションとプロファイリング
  • 登録のための構造正規化
  • リードホッピング用の新しい分子の提案と分子の偏りの回避
  • 化学ファイルのクリーンアップ

iconDotmatics Chemselector

ドットマティクスのChemselectorは、簡単なメンテナンスとアップデートで非常に大規模な化学データセットの超高速検索ができます。ブラウジングとフィルタリングに焦点を当てた最新のユーザーインターフェースで化合物、試薬、サンプルを検索。eMolecules+ for Chemselectorでは、高度にキュレーションされたeMoleculesのデータセットが利用できます。

Chemselector

  • 高性能な検索、フィルター、選択機能で、以下のような医薬合成化学のワークフローをサポートします。
    • ビルディングブロックの選択
    • フラグメントセットデザイン
    • 足場ホッピングのためのスクリーニング分子の選択
    • hit to leadキャンペーンのための化学シリーズの検証
  • eMolecules+ for Chemselectorや、ChEMBL for Chemselectorなどのドットマティクスが提供するデータセット、または企業や公共のデータベース、社内で構築したデータセットが利用できます。

eMolecules+ for Chemselector

  • 何百ものサプライヤーから2000万以上の化合物と800万以上の化学物質の在庫情報、価格、包装情報を確認できます。
  • eMoleculesに追加情報を提供し、検索を強化することができます。
  • 最新のeMoleculesサプライヤーとカタログデータを提供します。