抗体開発

最新の抗体創薬研究をサポート

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概要

抗体開発のためのインフォマティクス

抗体医薬品は、市場をリードする医薬品の一種です。現在では従来の形態に加えて、二重・三重特異性抗体、抗体薬物複合体、融合タンパク質なども存在します。抗体医薬品の種類が多様化するにつれて、研究データの管理にも課題が出てきました。ドットマティクスは、さまざまな抗体医薬品の開発に柔軟に対応するインフォマティクス・ソリューションを提供し、最新の抗体創薬研究をサポートします。

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チャレンジ

課題

DNA Sequence Icon

NGSやサンガーシーケンスのデータを簡単に解析、アノテーションすることができますか?

シーケンスデータのアセンブリ、アノテーション、および解析のためのバイオインフォマティクス・パイプラインは、煩雑でエラーが発生しやすい作業です。信頼性が高く、正確で、合理化されたワークフローで、シーケンスデータの解析を加速し、データ処理ではなく科学に集中することが必要です。

DNA to Table Icon

抗体候補の設計と選択を最適化するために、実験情報と配列情報を関連付けできますか?

抗体医薬品の効果を決定する要因は数多くあります。実験データと候補の配列を一緒に見て、配列のバリエーションの影響を理解し、候補をさらに最適化するためにターゲットとなる変異を検討することが必要です。

DNA Icon

すべての科学データを記録できますか?

抗体創薬研究では、免疫プロトコルやタンパク質生産などの一般的なワークフローに加え、最新の研究に対応するためのイノベーションも必要です。

知的財産を保護できますか?

競争が激しい創薬業界において、抗体デザインや実験プロセスなどの研究データ(知的財産)を完全に保護することも大切です。

特徴

ドットマティクスのソリューション

icon シーケンスデータの解析と可視化

ドットマティクスのソリューションは、統合された使いやすい環境で、独自の配列解析タスクを実行することができます。Geneious Biologicsを使用すれば、NGSやサンガーシーケンスのデータの読み込み、アセンブル、アノテーション、解析を単一のワークスペースで行うことができます。標準化されたツールで、高品質なデータと信頼性の高い結果が得られます。

icon 候補の設計と最適化のために配列と実験データを関連付け

科学的な知識や専門性を適用するには、データへのアクセスと、関連する情報から結論を導き出す能力が必要です。Geneious Biologicsは、実験データと抗体の配列データをワンビューで表示することができます。どの配列モチーフが生物物理学的特性の向上または悪化と相関しているかを簡単に確認することができるため、最適な候補を選択し、さらなる配列の最適化を提案することができます。

icon 幅広い分野の実験データを記録

ドットマティクスのソリューションは、免疫プロトコルやタンパク質生成ワークフローなどの一般的な抗体創薬のワークフローに対応できる他、多様化する抗体医薬品の開発のためのアドホックな実験にも対応できます。最新のソリューションでは、データ収集を自動化することで、データの品質が確保でき、研究を迅速に進めることができます。ドットマティクスの電子実験ノート(ELN)であるStudies Notebookは、最新の抗体創薬研究をサポートします。

icon いつでも簡単に研究データを可視化

ドットマティクスのソリューションがあれば、いつでも簡単に研究データ検索・参照し、可視化することができます。例えば、Dotmatics Browser では、関連するすべてのデータを収集し、ひとつのビューで確認することができます。研究データの全体像を見ることで、十分な情報に基づいた迅速な意思決定を促進します。また、Dotmatics Vortexでは、CDRやその他の重鎖・軽鎖配列を見ることができます。候補を最適化する際には、突然変異の影響をテストするための “what-if “実験を行うことができます。

icon エンティティの登録、関係性の追跡、知的財産の保護

抗体創薬研究では、最適化された重鎖と軽鎖の適切な組み合わせを見つけることが重要です。競争が激しい創薬業界において、抗体デザインや実験プロセスなどの研究データ(知的財産)を完全に保護することは大切です。 Dotmatics Bioregisterでは、さまざまなエンティティを登録し、その関係性の追跡をすることができ、組織の知的財産を完全に保護します。

製品

このソリューションで使用する製品

iconGeneious Biologics

Geneious Biologicsは、抗体および抗体様配列をスクリーニングするための、クラウドベースのソフトウェア ソリューションです。Geneious Biologicsでは、インタラクティブで使いやすいWebインターフェイスを介して、統合されたデータセットを分析し、探索することができます。

  • 設定可能で正確、かつスケーラブルな解析パイプラインにより、配列のアノテーションやバリデーションを行うことができます。
  • パワフルな可視化、クラスタリング、検索機能で、シーケンスから貴重なインサイトを得ることができます。
  • サンガー、NGS、Single Cellなど、あらゆるサイズのデータセットを活用して、候補選定を大幅にスピードアップします。
  • 安全で共有可能なクラウド環境で、データ管理を変革し、プロセスを効率化します。

iconDotmatics Browser

ドットマティクスの Browser は、強力な Web ベースの検索・レポーティングソリューションです。ドットマティクスおよびサードパーティの研究データベース全体を横断した検索ができ、保存場所に関係なく、必要なときにすべてのデータにアクセスできます。

  • 化学、生物学、アッセイ、実験ノート、その他の研究データベースを横断する検索と参照機能。
  • 部分構造や構造類似性などから検索ができます。
  • プロジェクトレベルおよび個人で、フォーム、ビュー、クエリ、リスト、レポートを作成できます。
  • フォーム、表、チャートで、科学データを可視化します。

iconDotmatics Studies Notebook

ドットマティクスのStudies Notebookは、幅広い分野の実験を記録、保存、検索するためのフレキシブルな電子実験ノート(ELN)です。

  • ドットマティクスのStudies Notebookは、科学者が実験を記録、保存でき、チームメンバー全員と簡単に共有できる電子実験ノート(ELN)です。また、IPの保護と監査が可能で、署名ワークフローを定義することもできます。
  • 合成化学やタンパク質精製などの高度に構造化された実験だけでなく、標的分子の同定や生物学的製剤開発のためのアドホックな実験にも対応。柔軟なテンプレートは、紙ベースの実験ノートからの移行をサポートします。
  • ドットマティクスのStudies Notebookがあれば、組織内または組織間で複数の科学者による共同作業が可能です。

iconDotmatics Bioregister

ドットマティクスのBioregisterは、シーケンスベースの生物由来エンティティ、化学修飾された生物由来エンティティ、構造式ベースではない生物由来エンティティを登録するためのWebベースのアプリケーションです。研究組織はエンティティの一意性を確保し、知的財産を保護することができます。

ドットマティクスのBioregisterは、DNA、RNA、ペプチド、タンパク質、抗体、コンジュゲート、非天然ペプチド、ヌクレオチド、プラスミド、細胞株、ユーザー定義の生物由来エンティティなど、幅広い生物由来エンティティの管理をサポートします。また、ユーザーは、これらのエンティティのバッチやサンプル、精製および発現情報、その他のタンパク質生成データを記録することができます。

  • 化学修飾された配列や構造式ベースではないエンティティ、関連する属性データや系統を含む生物由来エンティティを記録し、管理します。
  • 天然および非天然のエンティティの化学記述を生成します(可能な場合)。
  • エンティティの一意性を判断し、登録番号を割り当てます。
  • タンパク質の発現、精製、特性評価など、エンティティの生産に関連するデータを管理します。
  • 生産されたタンパク質のバッチとサンプルを記録し、関係性を追跡します。

iconDotmatics Platform

ドットマティクスのPlatformは、ドットマティクスのすべてのアプリケーションを構築するための共通のプラットフォームで、シームレスなエンドツーエンドのワークフローが構築できます。

ドットマティクスのPlatformは、クラウド、オンプレミスで展開が可能。オープンなアーキテクチャのため、ワークフローにサードパーティ製のソフトウェアを統合することができます。ドットマティクスの Browserを併用することで、企業内、外部のデータを横断参照することもできます。

ドットマティクスのPlatformは、1つのプラットフォーム上にある統合ソリューションです。共通のデータモデル、コード、アーキテクチャを使用しているため、メンテナンスとアップデートが簡単。複数の技術やアーキテクチャを持つアプリケーションのプラットフォームと比較して、総所有コストを低く抑えることができます。

  • 各ワークフローをシームレスに接続します。
  • 管理者は、ユーザー、グループ、アプリケーション、設定を管理できます。
  • 自動化とサードパーティ製のソフトウェアとの統合のためのAPIを提供します。
  • ドットマティクスの Browserを併用すると、企業内、外部のデータからの横断参照ができます。

iconDotmatics Studies

ドットマティクスの Studies は、ハイコンテンツ(HCS)・ハイスループット(HTS)から用量反応・DMPKまで、あらゆるタイプのスクリーニング実験を記録および分析するための、スクリーニングデータ管理ソリューションです。

  • プレートベースおよび非プレートベースのアッセイの分析プロトコルを定義できます。
  • すぐに使えるアッセイプロトコル、カスタムアッセイプロトコル、カーブフィット計算、プレートリーダー、再利用できるプレートレイアウト機能。
  • 大容量のアッセイデータを管理。
  • 結果を自動で分類するためのルールを定義できます。
  • スクリーニングプロトコルを適用して結果の検証、実験の作成・処理を自動化。
  • 処理が完了して検証されると、スクリーニング結果は Browser を介してチームと共有されます。

iconDotmatics Platform

The Dotmatics Platform is the common framework that supports the Dotmatics web-based scientific applications and allows them to work together to provide users seamless end-to-end workflows. The Platform supports managed deployments in the Cloud or self-supported deployments on premise. An open architecture enables workflows to include third-party software integration. When used together with Dotmatics Browser the Platform allows federated data access across corporate and external research data.The Dotmatics Platform is completely unified – it provides common data models, code and architecture to support business workflows that span the capabilities of the individual applications. This is important for enterprise enablement of research organizations, providing ease of maintenance and development. It gives the lowest possible total cost of ownership compared to platforms that support their applications with less tightly integrated collections of multiple technologies and/or architectures with multiple development histories.

  • Provides the framework that supports all Dotmatics web-based scientific applications and allows them to work together to provide seamless workflows.
  • Portal for administrators to manage users and groups, applications and configurations
  • Provides APIs for automation and integration with 3rd party software
  • When used in conjunction with Dotmatics Browser provide access to data from across an organization and externally

iconDotmatics Inventory

Dotmatics Inventory is a fully searchable sample and materials inventory that tracks chemicals, biologics, instruments and associated data across a hierarchy of locations and manages the dispensing and plating workflows, as samples are moved through an R&D process.

  • Defines a hierarchy of storage locations for an organization
  • Track samples in containers such as bottles and plates in those storage locations
  • Manages research materials, reagents and assets
  • Manages the aliquoting and dispensing workflows to distribute samples for testing
  • Maintains a full audit trail
  • Allows for searching and reporting on inventory information alongside other corporate data

iconDotmatics Cascade

Dotmatics Cascade manages the requesting and assignment of laboratory tasks, and tracking the progression of samples, across multiple teams within an organization or across a collaborating network.

  • Dotmatics Cascade allows organizations to define available services, such as assay execution or analysis and the associated scientific team
  • Scientists create requests for services and submit compounds Service managers manage, group and assign requests for execution
  • Service team scientists accept requests, create and autopopulate experiments to execute them
  • Teams can see request status and monitor compound or sample progression