Bioregister
生物由来物質のエンティティ登録及びタンパク質発現プロセス管理
Dotmatics Bioregisterは配列(DNA、RNA、タンパク質)、抗体、抗体医薬結合、プラスミド、細胞株、ユーザー定義のエンティティを含む生物由来物質のエンティティ登録のためのウェブベースのアプリケーションです。またユーザーはエンティティ、全てのサンプル記録、クローンベクター、精製、発現データ及びその他のタンパク質産生データを記録することができます
主要な特徴
配列管理
- DNAまたはタンパク質配列から開始
- エンティティの系統を記録
- 直感的なシーケンスエディタを使用して変異配列を生成
- 点変異配列の列を素早く生成するための残基スキャン機能
- 変異配列を結合
- 追跡した関係性または標準(MSA)アルゴリズムを使用して野生型配列へと整列
- MWやPIや減衰係数などの属性を自動的に計算
- 残基/変異株をタンパク質ファミリーナンバリングやキメラなどの代替ナンバリングシステムで取扱う
- BLASTまたはPROSITEを使用して配列検索ができる
タンパク質産生データ管理
- 全体的なタンパク質産生プロセスを通してデータを管理し、生物の配列にリンクする
- 集中型データストレージを使用し、貴重な情報の紛失を防ぐ
- 発現ベクター、タンパク質タグ、発現量、精製手順、タンパク質濃度及び純度を記録
- ニーズに合わせてシステムをカスタマイズし、タンパク質産生プロセスの各過程で保存するエンティティのデータを拡張
- ブロット画像や構想、手順の描写も含む、過程を通したあらゆる文書を保存。
いくつかのシステムで弊社の生物由来物質の登録を試した結果、Bioregisterが一番簡単に使用でき、簡単に構成できると思いました。弊社が求めている全てのものが揃っており、数日以内に運用できました。バイオテック組織にとって理想的なシステムです。CSO:Biotech organization、英国